RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473380.1

MSL3-211, Transcript of MSL complex subunit 3, humanhuman

TSL 3

Gene MSL3, Length 433 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3-211ENST00000473380 DDX50Q9BQ39 737 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 BCL7BQ9BQE9 202 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 RTKNQ9BST9 563 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 VCX3BQ9H321 246 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 RGL1Q9NZL6 768 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 COL20A1Q9P218 1284 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MALT1Q9UDY8 824 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MSRAQ9UJ68 235 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 FBXL21Q9UKT6 434 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CCPG1Q9ULG6 757 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 METP08581 1390 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CLTCL1P53675 1640 aa4.86□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 SYCE3A1L190 88 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 XKRY2A2RUG3 117 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CAPN14A8MX76 684 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 H3BUI4 141 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PSMD9O00233 223 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CASC3O15234 703 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 NDST3O95803 873 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ALPPP05187 535 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ANXA6P08133 673 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 INHBAP08476 426 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ALPPL2P10696 532 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PCNAP12004 261 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ZNF24P17028 368 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PGM1P36871 562 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 HK3P52790 923 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 SLURP1P55000 103 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MANFP55145 182 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PSMC6P62333 389 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ARHGAP8P85298 464 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CDK17Q00537 523 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 IRF9Q00978 393 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 AMPD2Q01433 879 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PRKCEQ02156 737 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 DSC2Q02487 901 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ITIH3Q06033 890 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CYP4F3Q08477 520 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 TEFQ10587 303 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 EFEMP1Q12805 493 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MYO1EQ12965 1108 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PDK1Q15118 436 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 TESK1Q15569 626 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 NTRK2Q16620 822 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PLEKHN1Q494U1 663 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 FAM69AQ5T7M9 428 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CRTC3Q6UUV7 619 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 DNAAF5Q86Y56 855 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 DENND6AQ8IWF6 608 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 SYCP3Q8IZU3 236 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 GLIS1Q8NBF1 620 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CCDC150Q8NCX0 1101 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 GOLGA5Q8TBA6 731 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MIPOL1Q8TD10 442 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ZNF384Q8TF68 577 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 SLC13A3Q8WWT9 602 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 NLRP4Q96MN2 994 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 RUFY1Q96T51 708 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 KCNK16Q96T55 309 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 PKP4Q99569 1192 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 UQCC2Q9BRT2 126 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MAGEB5Q9BZ81 275 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 KLHL4Q9C0H6 718 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 SLC5A7Q9GZV3 580 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 USP44Q9H0E7 712 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 MMRN2Q9H8L6 949 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 HPS4Q9NQG7 708 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ACSS2Q9NR19 701 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CNNM1Q9NRU3 951 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 CATSPERZQ9NTU4 200 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 LMBRD1Q9NUN5 540 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 ABCB8Q9NUT2 735 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 GIMAP4Q9NUV9 329 aa4.85□□□□□ -1.63
MSL3-211ENST00000473380 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa4.85□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms