RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472218.1

RPS18-231, Transcript of ribosomal protein S18, human

TSL 2

Gene RPS18, Length 1,109 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS18-231	ENST00000472218	HOXD9	P28356	352 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MTHFR	P42898	656 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MAGEA4	P43358	317 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MMP13	P45452	471 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	LMAN1	P49257	510 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	GEM	P55040	296 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ZBTB17	Q13105	803 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MPP3	Q13368	585 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC38	Q502W7	563 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	LRRC8B	Q6P9F7	803 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF449	Q6P9G9	518 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CYS1	Q717R9	158 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MFN1	Q8IWA4	741 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	NPAS3	Q8IXF0	933 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CFAP52	Q8N1V2	620 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CNTD1	Q8N815	330 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	DDI1	Q8WTU0	396 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	WBP2	Q969T9	261 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MYEOV	Q96EZ4	313 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ASB16	Q96NS5	453 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	SERPINB12	Q96P63	405 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PSKH2	Q96QS6	385 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	RUFY1	Q96T51	708 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CCDC77	Q9BR77	488 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PDF	Q9HBH1	243 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	FETUB	Q9UGM5	382 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CDH7	Q9ULB5	785 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	OR51B4	Q9Y5P0	310 aa		11.01	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MAGEB16	A2A368	324 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	RIPK2	O43353	540 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PRAMEF12	O95522	483 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	EPO	P01588	193 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PSMB4	P28070	264 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CD68	P34810	354 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PHB	P35232	272 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	NTHL1	P78549	312 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	SULT2A1	Q06520	285 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	LBR	Q14739	615 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PDGFRL	Q15198	375 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	RARS2	Q5T160	578 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	IL31	Q6EBC2	164 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	GPR153	Q6NV75	609 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ARHGAP36	Q6ZRI8	547 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CIR1	Q86X95	450 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ITFG1	Q8TB96	612 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PYROXD1	Q8WU10	500 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	UBLCP1	Q8WVY7	318 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	FGF13	Q92913	245 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	IRF7	Q92985	503 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	TADA1	Q96BN2	335 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	IMP4	Q96G21	291 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	AGAP3	Q96P47	875 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MGME1	Q9BQP7	344 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	POLR1E	Q9GZS1	481 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MUC3B	Q9H195	1237 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CDC42EP4	Q9H3Q1	356 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ATP13A1	Q9HD20	1204 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	CCL26	Q9Y258	94 aa		11	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218		A0A0D9SEW6	157 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	SDR42E2	A6NKP2	422 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	NRG2	O14511	850 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	TSPAN3	O60637	253 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ZMPSTE24	O75844	475 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	SASH3	O75995	380 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ADH1C	P00326	375 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	IVL	P07476	585 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	NFKB1	P19838	968 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ACVRL1	P37023	503 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	MAPK8	P45983	427 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	NPY2R	P49146	381 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	SGSH	P51688	502 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	NRL	P54845	237 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	LAMB3	Q13751	1172 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	ZNF235	Q14590	738 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	STAT4	Q14765	748 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	RASA2	Q15283	850 aa		10.99	□□□□□ -0.65
RPS18-231	ENST00000472218	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	10.99	□□□□□ -0.65

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms