RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460573.5

C9orf3-209, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 443 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-209ENST00000460573 WASH3PC4AMC7 463 aa22.95■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 ZMPSTE24O75844 475 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 EPHX1P07099 455 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 ACVRL1P37023 503 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 CLCN6P51797 869 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 RWDD2BP57060 319 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 COPS2P61201 443 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 SERINC3Q13530 473 aa22.95■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 ZNF354CQ86Y25 554 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 TRIM58Q8NG06 486 aa22.95■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 SLC39A8Q9C0K1 460 aa22.95■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 ATP9BO43861 1147 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 SNAP91O60641 907 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 ALDH1A2O94788 518 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 CNR2P34972 360 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 WASP42768 502 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 SH2D3CQ8N5H7 860 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 TSTD1Q8NFU3 115 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 KRT35Q92764 455 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 HMCESQ96FZ2 354 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 FBRSQ9HAH7 460 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 ETNK2Q9NVF9 386 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 C2orf42Q9NWW7 574 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 CHD5Q8TDI0 1954 aa22.94■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 CFAP54Q96N23 3096 aa22.93■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 A0A1W2PQF6 199 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 K7ESF4 209 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 APBB3O95704 486 aa22.93■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 PRKCHP24723 683 aa22.93■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 CDKN2BP42772 138 aa22.93■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa22.92■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 SRCP12931 536 aa22.92■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 TDGF1P13385 188 aa22.92■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 HES6Q96HZ4 224 aa22.92■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 RAD54BQ9Y620 910 aa22.92■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 ACCSLQ4AC99 568 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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C9orf3-209ENST00000460573 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 FRS2Q8WU20 508 aa22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
C9orf3-209ENST00000460573 EFR3BQ9Y2G0 817 aa22.91■■□□□ 1.26
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