RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457926.5

AFG3L1P-215, Transcript of AFG3 like matrix AAA peptidase subunit 1, pseudogene, human

TSL 2

Gene AFG3L1P, Length 2,919 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SV2C	Q496J9	727 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TMEM135	Q86UB9	458 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HASPIN	Q8TF76	798 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SREK1	Q8WXA9	508 aa	Known RBP	18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SH3GL3	Q99963	347 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	WDCP	Q9H6R7	721 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		18.93	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TFEB	P19484	476 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PLK1	P53350	603 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SNX17	Q15036	470 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LPP	Q93052	612 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LRIG2	O94898	1065 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HNRNPL	P14866	589 aa	Known RBP eCLIP	18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	BEX3	Q00994	111 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FLOT2	Q14254	428 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PAFAH1B3	Q15102	231 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	TMC7	Q7Z402	723 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SATL1	Q86VE3	508 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ZSCAN18	Q8TBC5	510 aa	Predicted RBP	18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PCED1B	Q96HM7	432 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NPAS2	Q99743	824 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	WDR6	Q9NNW5	1121 aa	Known RBP	18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	XPR1	Q9UBH6	696 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DERA	Q9Y315	318 aa		18.92	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CBLB	Q13191	982 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SEPT6	Q14141	434 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GK3P	Q14409	553 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	AAGAB	Q6PD74	315 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DSEL	Q8IZU8	1212 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FSTL5	Q8N475	847 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LAMA3	Q16787	3333 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CCDC160	A6NGH7	325 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PMPCB	O75439	489 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	UQCRB	P14927	111 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ATP6V1B1	P15313	513 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CYP2B6	P20813	491 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GRIA2	P42262	883 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	FOLH1	Q04609	750 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CNPY1	Q3B7I2	92 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CWF19L1	Q69YN2	538 aa	Known RBP	18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ST13P4	Q8IZP2	240 aa	Predicted RBP	18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	OXSM	Q9NWU1	459 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926		A0A0G2JMZ2	1700 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		18.91	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CASTOR2	A6NHX0	329 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	AHSG	P02765	367 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ALDH1A3	P47895	512 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	RPL14	P50914	215 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	MTTP	P55157	894 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SATB1	Q01826	763 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PDK3	Q15120	406 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PCSK7	Q16549	785 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NXNL1	Q96CM4	212 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CNBD2	Q96M20	576 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SMO	Q99835	787 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	COLEC11	Q9BWP8	271 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CHST12	Q9NRB3	414 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CLIC5	Q9NZA1	410 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	APPL1	Q9UKG1	709 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	DTNA	Q9Y4J8	743 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	COL1A2	P08123	1366 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926		H3BNX3	289 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ATP5B	P06576	529 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CDK7	P50613	346 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ROR2	Q01974	943 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	SNAPC2	Q13487	334 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	NMD3	Q96D46	503 aa	Known RBP	18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	KATNBL1	Q9H079	304 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	GABRB3	P28472	473 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	ART3	Q13508	389 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	LIN52	Q52LA3	116 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	PAOX	Q6QHF9	649 aa		18.9	■□□□□ 0.62
AFG3L1P-215	ENST00000457926	CEP97	Q8IW35	865 aa		18.9	■□□□□ 0.62

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