RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 PTGIRP43119 386 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MAGEA9P43362 315 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC6A11P48066 632 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SOX9P48436 509 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CLCN6P51797 869 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 KDSRQ06136 332 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ENPP2Q13822 863 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 PON2Q15165 354 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 PTPRNQ16849 979 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 FBXO43Q4G163 708 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TMEM196Q5HYL7 178 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC181Q5TID7 509 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 APCDD1Q8J025 514 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ATPAF2Q8N5M1 289 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ALLCQ8N6M5 410 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 KDM1BQ8NB78 822 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 NETO2Q8NC67 525 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 UCMAQ8WVF2 138 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 C1orf54Q8WWF1 131 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MYO19Q96H55 970 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MRGPRX3Q96LB0 322 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 IL12RB2Q99665 862 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM118BQ9BPY3 351 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 OSBPL6Q9BZF3 934 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 LTB4R2Q9NPC1 389 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 STARD13Q9Y3M8 1113 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 C5orf60A6NFR6 353 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM170BA6NMN3 283 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 PRRT4C9JH25 899 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 J3KR12 359 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 DFFAO00273 331 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 DLL1O00548 723 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MATN3O15232 486 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MTSS1O43312 755 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SNAP91O60641 907 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 KAT7O95251 611 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ASLP04424 464 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GLDCP23378 1020 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 PTPN3P26045 913 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GRIA2P42262 883 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GDF10P55107 478 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SULT2A1Q06520 285 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ZBTB17Q13105 803 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MBLAC2Q68D91 279 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CCDC13Q8IYE1 715 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SYNPOQ8N3V7 929 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MMGT1Q8N4V1 131 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CNTD1Q8N815 330 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CEP112Q8N8E3 955 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MNS1Q8NEH6 495 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 PJA1Q8NG27 643 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 HTR3CQ8WXA8 447 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 RUNDC3BQ96NL0 473 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 PSKH2Q96QS6 385 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 VAT1Q99536 393 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 MUC3BQ9H195 1237 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP13A1Q9HD20 1204 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 AMACRQ9UHK6 382 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 VPS28Q9UK41 221 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SIT1Q9Y3P8 196 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TRIOO75962 3097 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TIMM44O43615 452 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP9BO43861 1147 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ATG13O75143 517 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GCATO75600 419 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 DLDP09622 509 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CTAGE8P0CG41 777 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 AOC1P19801 751 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CR2P20023 1033 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CD72P21854 359 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 RBL1P28749 1068 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 STIP1P31948 543 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 TNFRSF4P43489 277 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GALK1P51570 392 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 CLCN5P51795 746 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
SH3BP4-207ENST00000454947 SLC20A2Q08357 652 aa9.55□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms