RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 LEMD2Q8NC56 503 aa11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 RDM1Q8NG50 284 aa11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 FRMD6Q96NE9 622 aa11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 IMPAD1Q9NX62 359 aa11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.76□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 STX7O15400 261 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF286BP0CG31 522 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 MAPTP10636 758 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 THRAP10827 490 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 PRKAR1BP31321 381 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CNTN1Q12860 1018 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 MICU2Q8IYU8 434 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 LRRC57Q8N9N7 239 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ATG4CQ96DT6 458 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 RIC8BQ9NVN3 520 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 TDRKHQ9Y2W6 561 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 SMCO3A2RU48 225 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 A8MUI8 341 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 SH3BGRLO75368 114 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 KATNA1O75449 491 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 MT-CO1P00395 513 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF23P17027 643 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 VAMP1P23763 118 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ROR2Q01974 943 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 EFEMP1Q12805 493 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 PDK4Q16654 411 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF606Q8WXB4 792 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 DMTF1Q9Y222 760 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 MST1RQ04912 1400 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 F5H5T6 163 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ASNA1O43681 348 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ALADP13716 330 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 IL1R1P14778 569 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ATP6V1B2P21281 511 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 HNF1BP35680 557 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 FAAP100Q0VG06 881 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 PRUNE1Q86TP1 453 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 FBXO32Q969P5 355 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 GPRASP2Q96D09 838 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 SLC35C2Q9NQQ7 365 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM150BA6NC51 233 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CFAP99D6REC4 459 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CALCAP01258 141 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ALBP02768 609 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CYP1A2P05177 515 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ACO1P21399 889 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 GRIK5Q16478 980 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 UTS2BQ765I0 119 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 C4orf19Q8IY42 314 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 SLITRK1Q96PX8 696 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CGRRF1Q99675 332 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 FICDQ9BVA6 458 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CISHQ9NSE2 258 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 BTBD7Q9P203 1132 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 MLXQ9UH92 298 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 LSM8O95777 96 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 KATNAL2Q8IYT4 538 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 USP18Q9UMW8 372 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 BCL9O00512 1426 aa11.75□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 NID2Q14112 1375 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 TXNL1O43396 289 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ACSL4O60488 711 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 PCDH8O95206 1070 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 AHSA1O95433 338 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ACADMP11310 421 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ETS1P14921 441 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ATP6V1C1P21283 382 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 AP1S2P56377 157 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 TAF5Q15542 800 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 EIF3MQ7L2H7 374 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 HPGDP15428 266 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ACADSBP45954 432 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 SLC9A3P48764 834 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 PDPK2PQ6A1A2 396 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 GDPD5Q8WTR4 605 aa11.74□□□□□ -0.53
CCBE1-202ENST00000439986 NACC2Q96BF6 587 aa11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms