RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421004.3

SCAMP1-AS1-201, SCAMP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SCAMP1-AS1, Length 1,479 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NEK5Q6P3R8 708 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GJB7Q6PEY0 223 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLK6Q92876 244 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC114Q96M63 670 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FZD3Q9NPG1 666 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KLHL11Q9NVR0 708 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 UCKL1Q9NWZ5 548 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BECN2A8MW95 431 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAGE1O75459 146 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DAB1O75553 588 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIAS2O75928 621 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 AKT2P31751 481 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHRNA3P32297 505 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 KRT83P78385 493 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CCDC15Q0P6D6 951 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PAK1Q13153 545 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF284Q2VY69 593 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C5orf22Q49AR2 442 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TRIM65Q6PJ69 517 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OLFML1Q6UWY5 402 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMC6Q7Z403 805 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C14orf80Q86SX3 495 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 HORMAD1Q86X24 394 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PASD1Q8IV76 773 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 WDTC1Q8N5D0 677 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ATP11CQ8NB49 1132 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR13H1Q8NG92 308 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARRDC3Q96B67 414 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 FAM81BQ96LP2 452 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PSMB7Q99436 277 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 LGMNQ99538 433 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CALN1Q9BXU9 219 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DYRK4Q9NR20 520 aa13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SNAP91O60641 907 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CNTN5O94779 1100 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MT-CO1P00395 513 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PRNPP04156 253 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RHOCP08134 193 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GIMD1P0DJR0 217 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALPPL2P10696 532 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CKMT1AP12532 417 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 USP8P40818 1118 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CXADRP78310 365 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 MORC3Q14149 939 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGAP44Q17R89 818 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ALFQ53S48 1182 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CDCP2Q5VXM1 449 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR6B2Q6IFH4 312 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GCNT7Q6ZNI0 430 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF248Q8NDW4 579 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 TMIEQ8NEW7 156 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 OR2A12Q8NGT7 310 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOX5Q96PH1 765 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CRACR2AQ9BSW2 395 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SIK2Q9H0K1 926 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 VPS51Q9UID3 782 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PCDHGC3Q9UN70 934 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CFAP46Q8IYW2 2715 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 K7ERQ8 282 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 M0QYT0 321 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 BIN1O00499 593 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERBB2P04626 1255 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 RRM1P23921 792 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NOS2P35228 1153 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CLCN6P51797 869 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PTPN20Q4JDL3 420 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 C22orf39Q6P5X5 142 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 SLC26A9Q7LBE3 791 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF843Q8N446 348 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DCAF4L2Q8NA75 395 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CHST14Q8NCH0 376 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APOLD1Q96LR9 279 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 DEPDC7Q96QD5 511 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 CAAP1Q9H8G2 361 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 PIGVQ9NUD9 493 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 NLGN3Q9NZ94 848 aa13.48□□□□□ -0.25
SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 APEX2Q9UBZ4 518 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms