RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPM1LQ5SGD2 360 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 BTBD8Q5XKL5 378 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SIX5Q8N196 739 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF139Q8WU17 664 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC25Q96NG3 672 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 HAPLN3Q96S86 360 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 NPY6RQ99463 290 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMOQ99835 787 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CENPKQ9BS16 269 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 DCLK3Q9C098 648 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 PHACTR1Q9C0D0 580 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SMOC2Q9H3U7 446 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLIC5Q9NZA1 410 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCML2Q9UQR0 700 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 NME7Q9Y5B8 376 aa10.2□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 STK25O00506 426 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 MTSS1O43312 755 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 STK10O94804 968 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPATA31D3P0C874 917 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CPB1P15086 417 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CREB1P16220 341 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 BDNFP23560 247 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 FSHRP23945 695 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERPINB6P35237 376 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDH6P55285 790 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 POLE2P56282 527 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 WDR4P57081 412 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 OGDHQ02218 1023 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSMD5Q16401 504 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 DCAF6Q58WW2 860 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SH2D4BQ5SQS7 431 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF220Q5VTB9 566 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC8B1Q6J4K2 584 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCYL2Q6P3W7 929 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 MTSS1LQ765P7 747 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 GSTA5Q7RTV2 222 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 TRABD2AQ86V40 505 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEFB106AQ8N104 65 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC44A3Q8N4M1 653 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 DTWD2Q8NBA8 298 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAML1Q92585 1016 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SHDQ96IW2 340 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CFAP57Q96MR6 1250 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SERPINB11Q96P15 392 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 BTBD10Q9BSF8 475 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 NDUFA13Q9P0J0 144 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 MTRRQ9UBK8 725 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CIDEBQ9UHD4 219 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZFP69BQ9UJL9 534 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 FBXW11Q9UKB1 542 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RASA4BC9J798 803 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ANHXE9PGG2 379 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 F8W8V4 182 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 APOL1O14791 398 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 TP73O15350 636 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RASA4O43374 803 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 DNAJC6O75061 913 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 PSMG1O95456 288 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ATF2P15336 505 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 IVDP26440 423 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 TKTP29401 623 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLCN2P51788 898 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RPL26P61254 145 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF33AQ06730 810 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 ADCY1Q08828 1119 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 VEPH1Q14D04 833 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RCN1Q15293 331 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC39A12Q504Y0 691 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RTP2Q5QGT7 225 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 MFSD7Q6UXD7 560 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 BNIPLQ7Z465 357 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RFX6Q8HWS3 928 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRC49Q8IUZ0 686 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 LZTR1Q8N653 840 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 EMC1Q8N766 993 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 TTC8Q8TAM2 541 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 STMN2Q93045 179 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAF2Q96CS3 445 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 B3GALT6Q96L58 329 aa10.19□□□□□ -0.78
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF157Q96PX1 679 aa10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms