RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 GPR27Q9NS67 375 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 KLF15Q9UIH9 416 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 COQ4Q9Y3A0 265 aa19.79■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 POM121BA6NF01 834 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 A6NNZ2 444 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 STX10O60499 249 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 RHOBTB3O94955 611 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 TGIF1Q15583 401 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 DEFB133Q30KQ1 61 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM270Q6UE05 265 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 USP53Q70EK8 1073 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 SH2D3CQ8N5H7 860 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 TPCN2Q8NHX9 752 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 BTN2A3PQ96KV6 586 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 SALL4Q9UJQ4 1053 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa19.78■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 RP1P56715 2156 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC187A0A096LP49 1063 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 TCAF2A6NFQ2 919 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 TCEA3O75764 348 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 PCDH8O95206 1070 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 GJB6O95452 261 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 PAEPP09466 180 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 NME1P15531 152 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 BRD2P25440 801 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 PDX1P52945 283 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 FGL2Q14314 439 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 TCERG1LQ5VWI1 586 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 XKR5Q6UX68 686 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 FEM1AQ9BSK4 669 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 ANKMY1Q9P2S6 941 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 OR51B4Q9Y5P0 310 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa19.77■□□□□ 0.76
HOXD12-201ENST00000404162 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 A0A1B0GVL5 298 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 KCNU1A8MYU2 1149 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 MUSKO15146 869 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 RAD51BO15315 384 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 AQP9O43315 295 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 NOBOXO60393 691 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 ITGA2BP08514 1039 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 FAM87AP0C7U9 286 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 SRCP12931 536 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 CHRNA3P32297 505 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 IRAK1P51617 712 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 CENPCQ03188 943 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 NR0B2Q15466 257 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM259Q4ZIN3 620 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 FAM174AQ8TBP5 190 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 LMX1AQ8TE12 382 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 SGF29Q96ES7 293 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa19.76■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 H3BM21 787 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 MT-CO1P00395 513 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 IGLV3-25P01717 112 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 MYL1P05976 194 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 EPB41P11171 864 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 SLC5A2P31639 672 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 OXCT1P55809 520 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4EBP2Q13542 120 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 TPRG1LQ5T0D9 272 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 FBXL22Q6P050 247 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 CHST14Q8NCH0 376 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 OR2A12Q8NGT7 310 aa19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 K7ERQ8 282 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 AFPP02771 609 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 NTRK1P04629 796 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 PFKFB1P16118 471 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 JUNDP17535 347 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 RPL34P49207 117 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC15Q0P6D6 951 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 EDRF1Q3B7T1 1238 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 RABGAP1LQ5R372 815 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 BEND5Q7L4P6 421 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 PARGQ86W56 976 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 SLC35F3Q8IY50 421 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 TMIEQ8NEW7 156 aa19.74■□□□□ 0.75
HOXD12-201ENST00000404162 KAT5Q92993 513 aa19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.5 ms