RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 HDDC3Q8N4P3 179 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 OR8K1Q8NGG5 319 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF653Q96CK0 615 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ERLEC1Q96DZ1 483 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 LRIG1Q96JA1 1093 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMB7Q99436 277 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP13A1Q9HD20 1204 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 TAS2R14Q9NYV8 317 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PPM1HQ9ULR3 514 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 FZD10Q9ULW2 581 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CHD5Q8TDI0 1954 aa8.7□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0D9SEW6 157 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PATE3B3GLJ2 98 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 MID1O15344 667 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 DFNA5O60443 496 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SNAP91O60641 907 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 OPHN1O60890 802 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ZMPSTE24O75844 475 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 GJB6O95452 261 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ENGP17813 658 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 EPHB2P29323 1055 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CASP14P31944 242 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CHRNA3P32297 505 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ACSL1P33121 698 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PCK1P35558 622 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PSMD8P48556 350 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 GALCP54803 685 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 NFKBIBQ15653 356 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PARP15Q460N3 678 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ARTNQ5T4W7 220 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 KIAA0895LQ68EN5 471 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 NEK5Q6P3R8 708 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ZSCAN30Q86W11 494 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB119Q8N690 84 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC185Q8N715 623 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 OR52K2Q8NGK3 314 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 C1orf216Q8TAB5 229 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 TCEAL3Q969E4 200 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM131CQ96AQ9 280 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 PPP1R16AQ96I34 528 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 DNAJC7Q99615 494 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 NEUROG2Q9H2A3 272 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SMOC1Q9H4F8 434 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 MTG2Q9H4K7 406 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC32A1Q9H598 525 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 DYRK4Q9NR20 520 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF2B4Q9UI10 523 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CHD8Q9HCK8 2581 aa8.69□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 LAMA1P25391 3075 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 KNTC1P50748 2209 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A1W2PP55 124 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM170AA1A519 330 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM72CH0Y354 149 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 MYO1FO00160 1098 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 KDELR3O43731 214 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CREB3O43889 395 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 FSBPO95073 299 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CER1O95813 267 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 GSRP00390 522 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 MT-CO1P00395 513 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 GYPCP04921 128 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF883P0CG24 379 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 GRIA4P48058 902 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 NDST2P52849 883 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 TPI1P60174 286 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 RACK1P63244 317 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 RAD51Q06609 339 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SEMA3BQ13214 749 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC45A4Q5BKX6 768 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CARD16Q5EG05 197 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 CCDC122Q5T0U0 273 aa8.68□□□□□ -1.02
MT-TS1-201ENST00000387416 TMCO4Q5TGY1 634 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms