RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376854.5

C9orf40-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 40, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf40, Length 2,327 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40-201ENST00000376854 TREHO43280 583 aa25.75■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 AP1G2O75843 785 aa25.75■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 PPP1R36Q96LQ0 422 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 GPR22Q99680 433 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 APBA2Q99767 749 aa25.74■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 OR12D3Q9UGF7 316 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa25.74■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 GRIA4P48058 902 aa25.73■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 DRC3Q9H069 523 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 WDCPQ9H6R7 721 aa25.73■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 AIM2O14862 343 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 HDAC3O15379 428 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 THRAP10827 490 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 CD1EP15812 388 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 PIK3R1P27986 724 aa25.72■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 SEL1L3Q68CR1 1132 aa25.72■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP25.72■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 TKTL2Q9H0I9 626 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 H3BNX3 289 aa25.72■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 TLK2Q86UE8 772 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 TMEM151AQ8N4L1 468 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 PCED1BQ96HM7 432 aa25.72■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
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C9orf40-201ENST00000376854 MYBPHLA2RUH7 354 aa25.71■■□□□ 1.71
C9orf40-201ENST00000376854 PGGT1BP53609 377 aa25.71■■□□□ 1.71
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