RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FRG2BQ96QU4 278 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CLSTN3Q9BQT9 956 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TAOK3Q9H2K8 898 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ZDHHC7Q9NXF8 308 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 GJD2Q9UKL4 321 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SUFUQ9UMX1 484 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MST1RQ04912 1400 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A0A0MQY5 61 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6C68A6NDL8 312 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SOCS2O14508 198 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NDUFB8O95169 186 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 EPN2O95208 641 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PTPN9P43378 593 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXO43Q4G163 708 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MANEAQ5SRI9 462 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 LVRNQ6Q4G3 990 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 GPSM1Q86YR5 675 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TMTC1Q8IUR5 882 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TBATAQ96M53 351 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 IFT27Q9BW83 186 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR63Q9BZJ6 419 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF146Q9NTX7 359 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 DECR2Q9NUI1 292 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PDP2Q9P2J9 529 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NLKQ9UBE8 527 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 DHDHQ9UQ10 334 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF521Q96K83 1311 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 EYA2O00167 538 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TMCC1O94876 653 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CBX6O95503 412 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFRSF1BP20333 461 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CD72P21854 359 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TNFSF8P32971 234 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PGM1P36871 562 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PLCD1P51178 756 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 VAMP2P63027 116 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TRPC3Q13507 836 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC18A3Q16572 532 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 SYTL3Q4VX76 610 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NUGGCQ68CJ6 796 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 RETSATQ6NUM9 610 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM74Q86UV6 250 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM73Q86UV7 250 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR5BQ86VZ2 330 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 DPP10Q8N608 796 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM1BQ8NB78 822 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HVCN1Q96D96 273 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CD180Q99467 661 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP4.17□□□□□ -1.748e-20■■□□□ 12.5
RABGGTB-202ENST00000370826 LMAN2LQ9H0V9 348 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MROH8Q9H579 483 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP6D1Q9H9H5 199 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FZD3Q9NPG1 666 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 POT1Q9NUX5 634 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 GRHL1Q9NZI5 618 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PGAP2Q9UHJ9 254 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH22Q9UJ99 828 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ANAPC4Q9UJX5 808 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HSF4Q9ULV5 492 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CLDN16Q9Y5I7 305 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 HBP1O60381 514 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TULP3O75386 442 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 IFNA2P01563 188 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 CHRM4P08173 479 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 PTGER1P34995 402 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TUBP50607 506 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 LAMB3Q13751 1172 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 NAA25Q14CX7 972 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TWIST1Q15672 202 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 RPE65Q16518 533 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 LRRC8DQ7L1W4 858 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM217AQ8IXS0 508 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM185AQ8N0U4 392 aa4.16□□□□□ -1.74
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