RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000360752.4

RDH16-201, Transcript of retinol dehydrogenase 16, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RDH16, Length 3,198 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16-201ENST00000360752 TPSB2P20231 275 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 GRM1Q13255 1194 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SEMA5AQ13591 1074 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 USP10Q14694 798 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TPSAB1Q15661 275 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 DGKDQ16760 1214 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 PITRM1Q5JRX3 1037 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 GK5Q6ZS86 529 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 URGCPQ8TCY9 931 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 EXT2Q93063 718 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TMIGD2Q96BF3 282 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 PKP2Q99959 881 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 FERMT1Q9BQL6 677 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 MTMR10Q9NXD2 777 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 NEMP2A6NFY4 417 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 C9JVG2 144 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TRIM13O60858 407 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 DNAJA2O60884 412 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SPRP35270 261 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ETFBP38117 255 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TMED10P49755 219 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 CLCN2P51788 898 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 NIPAL4Q0D2K0 466 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ZNF280DQ6N043 979 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 UGT2A3Q6UWM9 527 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 DNERQ8NFT8 737 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ATP6V1E2Q96A05 226 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 NACA2Q9H009 215 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SPATC1LQ9H0A9 340 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 WDR41Q9HAD4 459 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 BFARQ9NZS9 450 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SNX13Q9Y5W8 968 aa9.91□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 PROZP22891 400 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 MAGEA3P43357 314 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 CDKL1Q00532 357 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 CTBP1Q13363 440 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 POU6F1Q14863 301 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TRIML2Q8N7C3 387 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SLC7A14Q8TBB6 771 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TRPM4Q8TD43 1214 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 RNF139Q8WU17 664 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 RTP4Q96DX8 246 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 MED10Q9BTT4 135 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 DNAJC28Q9NX36 388 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 NUP205Q92621 2012 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 KPNA7A9QM74 516 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 FAM72CH0Y354 149 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 EEF2KO00418 725 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 MDM4O15151 490 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ATP6AP2O75787 350 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ZBTB7AO95365 584 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ICAM3P32942 547 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 OAZ1P54368 228 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 CEACAM7Q14002 265 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 FAM72AQ5TYM5 149 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 FAM72DQ6L9T8 149 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 PGM2L1Q6PCE3 622 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 KCNMB4Q86W47 210 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 FAM72BQ86X60 149 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 LILRA2Q8N149 483 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 MYO1HQ8N1T3 1032 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SERPINI1Q99574 410 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 SLC39A3Q9BRY0 314 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 Q9H521 79 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 CYP3A43Q9HB55 503 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 PSMD13Q9UNM6 376 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 TRIM17Q9Y577 477 aa9.9□□□□□ -0.82
RDH16-201ENST00000360752 ANKRD12Q6UB98 2062 aa9.9□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 FBP2O00757 339 aa9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 ZNF195O14628 629 aa9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 CNTFP26441 200 aa9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 PHEXP78562 749 aa9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 SEPT6Q14141 434 aa9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 GRM3Q14832 879 aa9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 DPYSL2Q16555 572 aa9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.89□□□□□ -0.83
RDH16-201ENST00000360752 KRT80Q6KB66 452 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms