RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 CRADDP78560 199 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 SEPT6Q14141 434 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 RGS21Q2M5E4 152 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 TMEM26Q6ZUK4 368 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 TMEM192Q8IY95 271 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 MCUQ8NE86 351 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 FNIP1Q8TF40 1166 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 PCDHAC1Q9H158 963 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 ACSS2Q9NR19 701 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 ADA2Q9NZK5 511 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 SUN2Q9UH99 717 aa17.1■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 MAGEA6P43360 314 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 CLCN3P51790 818 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 IGBP1P78318 339 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 PTK2BQ14289 1009 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 Q3C1V9 767 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 EEF1DP3Q658K8 133 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 CASC4Q6P4E1 433 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 ZPBP2Q6X784 338 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 WDR49Q8IV35 697 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 GPC2Q8N158 579 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 MOCOSQ96EN8 888 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 NPAS2Q99743 824 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 GID8Q9NWU2 228 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 CYTH4Q9UIA0 394 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 GNPTGQ9UJJ9 305 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 MGAMO43451 1857 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 TRIM64CA6NLI5 447 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 OGTO15294 1046 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 METTL18O95568 372 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 MPSTP25325 297 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 TYK2P29597 1187 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 NHSL2Q5HYW2 709 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 CMC1Q7Z7K0 106 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 GPR20Q99678 358 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa17.09■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 WDR27A2RRH5 827 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB42B2RXF5 422 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 GOLGA8TH3BQL2 631 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 CD19P15391 556 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 PMS2P3Q13401 168 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 TFDP2Q14188 446 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 MOGQ16653 247 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 DUOXA2Q1HG44 320 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 ZNF699Q32M78 642 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 RAB6CQ53S08 254 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 IER5Q5VY09 327 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 SLC15A4Q8N697 577 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 RTP4Q96DX8 246 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 SPATA33Q96N06 139 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 RAB6CQ9H0N0 254 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa17.08■□□□□ 0.33
GDE1-201ENST00000353258 C9IYK1 514 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 TRIM38O00635 465 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 ERBB2P04626 1255 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 CHRNGP07510 517 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 EFNA5P52803 228 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 PQLC3Q8N755 202 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 PLD5Q8N7P1 536 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 ASB9Q96DX5 294 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 EFCAB1Q9HAE3 211 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 HESX1Q9UBX0 185 aa17.08■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 CDH8P55286 799 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 GNA12Q03113 381 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 NIPAL4Q0D2K0 466 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 MFSD4BQ5TF39 518 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 HERC6Q8IVU3 1022 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 MINDY3Q9H8M7 445 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 PDGFCQ9NRA1 345 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 GIN1Q9NXP7 522 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 LOC285556D6RIA3 1793 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 SOCS7O14512 581 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 ESRRBO95718 433 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 HOXC6P09630 235 aa17.07■□□□□ 0.32
GDE1-201ENST00000353258 DCKP27707 260 aa17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms