RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329966.10

USP45-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 45, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP45, Length 1,444 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP45-202ENST00000329966 TNKS2Q9H2K2 1166 aa21.54■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 GRPEL1Q9HAV7 217 aa21.54■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 ITM2CQ9NQX7 267 aa21.54■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 RNF103O00237 685 aa21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 METAP1P53582 386 aa21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 CDH6P55285 790 aa21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 FAM71BQ8TC56 605 aa21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 DESI2Q9BSY9 194 aa21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 SERGEFQ9UGK8 458 aa21.53■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 NUMA1Q14980 2115 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 NUP205Q92621 2012 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 H3BRJ5 948 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 KDELR3O43731 214 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 BNIP3LO60238 219 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 ARHGAP25P42331 645 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 NOP2P46087 812 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 SERINC3Q13530 473 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 AFMIDQ63HM1 303 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 FAM124AQ86V42 546 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 TMEFF1Q8IYR6 380 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 SARDHQ9UL12 918 aa21.52■■□□□ 1.04
USP45-202ENST00000329966 MID1O15344 667 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ZNF217O75362 1048 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ETFBP38117 255 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PSMD8P48556 350 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 HADHBP55084 474 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 DPYSL3Q14195 570 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 KRT81Q14533 505 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 CST6Q15828 149 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PARP15Q460N3 678 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PMS2CLQ68D20 193 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 RETSATQ6NUM9 610 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 C22orf39Q6P5X5 142 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 CHST14Q8NCH0 376 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 OR2A12Q8NGT7 310 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 RAPGEF5Q92565 580 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 SPACA7Q96KW9 195 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 FBRSQ9HAH7 460 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 RAB23Q9ULC3 237 aa21.51■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 J3KR12 359 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 IGLV3-19P01714 112 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 CTSLP07711 333 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 COMTP21964 271 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ARL4AP40617 200 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PTGER3P43115 390 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 CLCN6P51797 869 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 NDST2P52849 883 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ARMCX6Q7L4S7 300 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 LCMT1Q9UIC8 334 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 CFAP54Q96N23 3096 aa21.5■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PLK4O00444 970 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 MAP3K13O43283 966 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 BUB1O43683 1085 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ACADMP11310 421 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 TNNT1P13805 278 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 SLC20A2Q08357 652 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 CCDC6Q16204 474 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 POM121L1PQ3SYA9 428 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 AADATQ8N5Z0 425 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 VOPP1Q96AW1 172 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 CALN1Q9BXU9 219 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PDFQ9HBH1 243 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 PPM1HQ9ULR3 514 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 HPCAL4Q9UM19 191 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ALG6Q9Y672 507 aa21.49■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 DFFAO00273 331 aa21.48■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 MCF2LO15068 1137 aa21.48■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 IL1BP01584 269 aa21.48■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 DNTTP04053 509 aa21.48■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 KRT7P08729 469 aa21.48■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 CD6P30203 668 aa21.48■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 SLC8A1P32418 973 aa21.48■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 ACSL1P33121 698 aa21.48■■□□□ 1.03
USP45-202ENST00000329966 VAV2P52735 878 aa21.48■■□□□ 1.03
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