RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 USP7Q93009 1102 aa24.5■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA13Q96N96 652 aa24.5■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 OSBPL6Q9BZF3 934 aa24.5■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 MYBL2P10244 700 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CRADDP78560 199 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PFKFB4Q16877 469 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 BROXQ5VW32 411 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 MTMR9Q96QG7 549 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SLITRK2Q9H156 845 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 IL1R1P14778 569 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 WEE1P30291 646 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SIGLEC16A6NMB1 481 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CALCAP01258 141 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 USP17L7P0C7H9 530 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TNK2Q07912 1038 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PPP3CAQ08209 521 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 REPS2Q8NFH8 660 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 KAT5Q92993 513 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PANX3Q96QZ0 392 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CDH9Q9ULB4 789 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 BANF1O75531 89 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TGFB3P10600 412 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 GSTM5P46439 218 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NT5DC4Q86YG4 428 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJB3Q8WWF6 145 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 BBS4Q96RK4 519 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PLA2G4CQ9UP65 541 aa24.49■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TBKBP1A7MCY6 615 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 OR7A2PQ8NGA2 310 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS45Q9NRW7 570 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PSME3P61289 254 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 KBTBD2Q8IY47 623 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NFKBIZQ9BYH8 718 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM216Q9P0N5 145 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 DIP2AQ14689 1571 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN3P26045 913 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SPIRE1Q08AE8 756 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NEPROQ6NW34 567 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 WDR60Q8WVS4 1066 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SPAG4Q9NPE6 437 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TSHRP16473 764 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 IL2P60568 153 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CRY1Q16526 586 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNQ5Q9NR82 932 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIM38O00635 465 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PGM3O95394 542 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNA2P20248 432 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 KIAA0408Q6ZU52 694 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ITIH5Q86UX2 942 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA20Q8TB22 786 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC19Q9H756 370 aa24.48■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 GRIA4P48058 902 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NR1D2Q14995 579 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM50BQ9Y247 325 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFB5O43674 189 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 BMP10O95393 424 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH2P05091 517 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SLIT1O75093 1534 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 AHCYL1O43865 530 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3BGRLO75368 114 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT17P0C025 328 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 RPL22P35268 128 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 RAB27AP51159 221 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 BTBD3Q9Y2F9 522 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NR1H2P55055 460 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 IZUMO1Q8IYV9 350 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PACSIN3Q9UKS6 424 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa24.47■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TAF4O00268 1085 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 PCDH8O95206 1070 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 IGSF6O95976 241 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ADSSP30520 456 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 NAGLUP54802 743 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ARCQ7LC44 396 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 GLIS3Q8NEA6 775 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 CERS2Q96G23 380 aa24.46■■□□□ 1.51
GNPTAB-201ENST00000299314 ELOVL4Q9GZR5 314 aa24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms