RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296127.7

ZDHHC3-201, Transcript of zinc finger DHHC-type containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene ZDHHC3, Length 3,101 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3-201ENST00000296127 CXorf38Q8TB03 319 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CNDP1Q96KN2 507 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 EGLN2Q96KS0 407 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZNF577Q9BSK1 485 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 LHPPQ9H008 270 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 AURKCQ9UQB9 309 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PTPRJQ12913 1337 aa14.92□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 RNF103-CHMP3A0A140T963 221 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SHMT1P34896 483 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 LRIT3Q3SXY7 679 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 RAB6CQ53S08 254 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 APBB2Q92870 758 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 MFSD14AQ96MC6 490 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 RAB6CQ9H0N0 254 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZNF229Q9UJW7 825 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ELK4P28324 431 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 RBL1P28749 1068 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SERPINB9P50453 376 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FSTL1Q12841 308 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC36A3Q495N2 470 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 C4orf22Q6V702 233 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TERB1Q8NA31 727 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TCF12Q99081 682 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TMEM9Q9P0T7 183 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TBX20Q9UMR3 447 aa14.91□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ILVBLA1L0T0 632 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TNNI1P19237 187 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TYK2P29597 1187 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 KRT76Q01546 638 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CUL2Q13617 745 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 VPS72Q15906 364 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ANO4Q32M45 955 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FAM102BQ5T8I3 360 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZNF534Q76KX8 674 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ANKFN1Q8N957 763 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 WDR70Q9NW82 654 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 DCDC2Q9UHG0 476 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 XYLBO75191 536 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PGGT1BP53609 377 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TMBIM6P55061 237 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 COPZ1P61923 177 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CASC4Q6P4E1 433 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 AKAP14Q86UN6 197 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 GATA5Q9BWX5 397 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CD209Q9NNX6 404 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 CNGB3Q9NQW8 809 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 PCM1Q15154 2024 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 WDR27A2RRH5 827 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 HOXC11O43248 304 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 VNN1O95497 513 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 ALOX5P09917 674 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 RARRES1P49788 294 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 FAM219BQ5XKK7 198 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 NACC2Q96BF6 587 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 AKIP1Q9NQ31 210 aa14.9□□□□□ -0.02
ZDHHC3-201ENST00000296127 GRID2O43424 1007 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 UFL1O94874 794 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 METTL18O95568 372 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 RACK1P63244 317 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 IRF9Q00978 393 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 OCA2Q04671 838 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 FPGSQ05932 587 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 ITPK1Q13572 414 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 DLG2Q15700 870 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 GPR162Q16538 588 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 STXBP5Q5T5C0 1151 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 DEPDC4Q8N2C3 294 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 SUN5Q8TC36 379 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 CLSTN3Q9BQT9 956 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 ZNF385DQ9H6B1 395 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 GAKO14976 1311 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 FOCADQ5VW36 1801 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 AP3B1O00203 1094 aa14.89□□□□□ -0.03
ZDHHC3-201ENST00000296127 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms