RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295874.14

PTPRG-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRG, Length 4,650 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL24Q6TFL4 600 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 USP33Q8TEY7 942 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 WNK4Q96J92 1243 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 NFKBIZQ9BYH8 718 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 GSC2O15499 205 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 KLHL18O94889 574 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 GJB1P08034 283 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 PAX7P23759 505 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 GSCP56915 257 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SGCGQ13326 291 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 PLD1Q13393 1074 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TMC5Q6UXY8 1006 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 NEK10Q6ZWH5 1172 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 KRT74Q7RTS7 529 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CALML6Q8TD86 181 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 PPP1R36Q96LQ0 422 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 C7orf26Q96N11 449 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CRLS1Q9UJA2 301 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 MYO1GB0I1T2 1018 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 DLGAP3O95886 979 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 GRK3P35626 688 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SOX6P35712 828 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 MPP2Q14168 576 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 PLCL1Q15111 1095 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CHADLQ6NUI6 762 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TAF2Q6P1X5 1199 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 MCRS1Q96EZ8 462 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 RBBP8Q99708 897 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 WDCPQ9H6R7 721 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 AP1G2O75843 785 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TMEM63AO94886 807 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TPSB2P20231 275 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 NUDT2P50583 147 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TPSAB1Q15661 275 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 IKBIPQ70UQ0 350 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SLC2A14Q8TDB8 520 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 FBXO32Q969P5 355 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SDCBP2Q9H190 292 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 FZD8Q9H461 694 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 MORF4L1Q9UBU8 362 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ADAM30Q9UKF2 790 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 DSEQ9UL01 958 aa12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TRPC5OSA6NMA1 111 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CYB561D2O14569 222 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 PDE5AO76074 875 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ADIGQ0VDE8 80 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SEL1L3Q68CR1 1132 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 GPC2Q8N158 579 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ANKRD52Q8NB46 1076 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TNIP2Q8NFZ5 429 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 BHMTQ93088 406 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CCDC3Q9BQI4 270 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 EBF2Q9HAK2 575 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 GPRC5DQ9NZD1 345 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 COL4A1P02462 1669 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ZNF839A8K0R7 811 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 NDUFB5O43674 189 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 KRT36O76013 467 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SERPINA6P08185 405 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CCT8P50990 548 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CACNA2D1P54289 1103 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SKP1P63208 163 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 CLDN10P78369 228 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 OGDHQ02218 1023 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 SPDYAQ5MJ70 313 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 UNC5AQ6ZN44 842 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 RNF135Q8IUD6 432 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 LRRC52Q8N7C0 313 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 IPMKQ8NFU5 416 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 ELMO2Q96JJ3 720 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 RRN3Q9NYV6 651 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 TRHDEQ9UKU6 1024 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 PTPRJQ12913 1337 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 C2CD4BA6NLJ0 364 aa12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 STX7O15400 261 aaKnown RBP12.49□□□□□ -0.41
PTPRG-201ENST00000295874 PCDH8O95206 1070 aa12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms