RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293845.7

CCDC42-201, Transcript of coiled-coil domain containing 42, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CCDC42, Length 1,374 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC42-201ENST00000293845 SRCP12931 536 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MX2P20592 715 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PRKCHP24723 683 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 AVPR2P30518 371 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NNMTP40261 264 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 GARSP41250 739 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NR2C2P49116 596 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NUMBP49757 651 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 IL10RBQ08334 325 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CRY1Q16526 586 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SEL1L2Q5TEA6 688 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 KAZNQ674X7 775 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SDE2Q6IQ49 451 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 AADACL2Q6P093 401 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CCDC33Q8N5R6 958 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NETO2Q8NC67 525 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HDAC11Q96DB2 347 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 OLFM3Q96PB7 478 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CD248Q9HCU0 757 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa13.51□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 WASH3PC4AMC7 463 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 KCNK3O14649 394 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ENC1O14682 589 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MAFKO60675 156 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TJP3O95049 919 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MT-CO1P00395 513 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 APOC2P02655 101 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HOXB2P14652 356 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CCR3P51677 355 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 GNG11P61952 73 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 DYNLT1P63172 113 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF33AQ06730 810 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LLGL1Q15334 1064 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 LINGO4Q6UY18 593 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF354CQ86Y25 554 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ATPAF2Q8N5M1 289 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 FRS2Q8WU20 508 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 FATE1Q969F0 183 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TSGA13Q96PP4 275 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CEP44Q9C0F1 390 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SP110Q9HB58 689 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SUN2Q9UH99 717 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ANKRD36A6QL64 1941 aa13.5□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 EML5Q05BV3 1969 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 A0A1W2PQF6 199 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TTC34A8MYJ7 566 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 J3KR12 359 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 MAP3K6O95382 1288 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PEX11BO96011 259 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 C7P10643 843 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 WASP42768 502 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NUBP1P53384 320 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 STARD3Q14849 445 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PDK1Q15118 436 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 C22orf39Q6P5X5 142 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 NPNTQ6UXI9 565 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TMEM92Q6UXU6 159 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ATP11CQ8NB49 1132 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 DTWD2Q8NBA8 298 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 P3H4Q92791 437 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PTPRN2Q92932 1015 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF599Q96NL3 588 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 WDR24Q96S15 920 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HEMGNQ9BXL5 484 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PRMT8Q9NR22 394 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 C2orf42Q9NWW7 574 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SLC8A2Q9UPR5 921 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 HEY1Q9Y5J3 304 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ACTL7AQ9Y615 435 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa13.49□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 K7ERQ8 282 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 TMCC1O94876 653 aa13.48□□□□□ -0.25
CCDC42-201ENST00000293845 EPHX1P07099 455 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms