RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000260116.4

TTPA-201, Transcript of alpha tocopherol transfer protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTPA, Length 2,338 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPA-201ENST00000260116 NR1H3Q13133 447 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 UBXN2BQ14CS0 331 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PTPRNQ16849 979 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ATP11CQ8NB49 1132 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SPATA4Q8NEY3 305 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 KRT12Q99456 494 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SP110Q9HB58 689 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PRKAG3Q9UGI9 489 aa11.08□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 COL4A2P08572 1712 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ILVBLA1L0T0 632 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SGK1O00141 431 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PEX11BO96011 259 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 JCHAINP01591 159 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MAPKAPK2P49137 400 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 OXCT1P55809 520 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SLC7A5Q01650 507 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 GALNT2Q10471 571 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 AFMIDQ63HM1 303 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 GRAMD4Q6IC98 578 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 FSTL4Q6MZW2 842 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 Q6ZVU0 165 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 FAM3CQ92520 227 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MYO19Q96H55 970 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NSMCE3Q96MG7 304 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TRIM31Q9BZY9 425 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SLC6A17Q9H1V8 727 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ARHGEF3Q9NR81 526 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 FBXO10Q9UK96 956 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 A0A0U1RQS6 177 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 WASH4PA8MWX3 477 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MCF2LO15068 1137 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 RNF40O75150 1001 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ZMPSTE24O75844 475 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 DCNP07585 359 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PRLRP16471 622 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TGM2P21980 687 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PTPN7P35236 360 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 METAP1P53582 386 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 IHHQ14623 411 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TRADDQ15628 312 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TJAP1Q5JTD0 557 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CCDC105Q8IYK2 499 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CHPFQ8IZ52 775 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PGBD5Q8N414 524 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ALLCQ8N6M5 410 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CNTD1Q8N815 330 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SLC35B2Q8TB61 432 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PNKPQ96T60 521 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TRIM51Q9BSJ1 452 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ELOVL2Q9NXB9 296 aa11.07□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CCNB1P14635 433 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TARSP26639 723 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 IL12RB1P42701 662 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PAFAH1B1P43034 410 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 CLCN6P51797 869 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NDST2P52849 883 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ECT2LQ008S8 904 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ITKQ08881 620 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PTPRRQ15256 657 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 OASLQ15646 514 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MLF2Q15773 248 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 RNF43Q68DV7 783 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 GSTA5Q7RTV2 222 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 SPATA22Q8NHS9 363 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MAGEH1Q9H213 219 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PDFQ9HBH1 243 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 USP29Q9HBJ7 922 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NT5MQ9NPB1 228 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ESYT3A0FGR9 886 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TTI1O43156 1089 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 TMCC1O94876 653 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 HLA-DQB2P05538 268 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 WASHC5Q12768 1159 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ZNF234Q14588 700 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 PARP15Q460N3 678 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 LRRC73Q5JTD7 316 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 KIAA1211LQ6NV74 962 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 AHI1Q8N157 1196 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa11.06□□□□□ -0.64
TTPA-201ENST00000260116 HTR3CQ8WXA8 447 aa11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms