RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 PNPLA8Q9NP80 782 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL8BQ9NVJ2 186 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR35Q9P2L0 1181 aa26.91■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 C19orf67A6NJJ6 358 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEC1O60732 1142 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMG1O95456 288 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 DLDP09622 509 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM200BP0CF97 657 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 STIP1P31948 543 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP4F8P98187 520 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX30Q5VWJ9 437 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ITIH5Q86UX2 942 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA17Q96L03 361 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 LIMD1Q9UGP4 676 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 HHLA1C9JL84 531 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8SH3BPF8 625 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA8MH3BSY2 632 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFRSF10BO14763 440 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 CSH1P0DML2 217 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 CSH2P0DML3 217 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 RAP1GDS1P52306 607 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 TBCCQ15814 346 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ARHGAP17Q68EM7 881 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 HAUS1Q96CS2 278 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP16Q9BY84 665 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK13Q9HB14 408 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 KCNK4Q9NYG8 393 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC17A7Q9P2U7 560 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 CST8O60676 142 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 APOC2P02655 101 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 F11P03951 625 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ASGR2P07307 311 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 VDRP11473 427 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 KDELR1P24390 212 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 AP1B1Q10567 949 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 RCN1Q15293 331 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 MSS51Q4VC12 460 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD22Q5VYY1 191 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 TSC22D3Q99576 134 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 LHX5Q9H2C1 402 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 ATXN3LQ9H3M9 355 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 SCOCQ9UIL1 159 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-201ENST00000246533 INHBAP08476 426 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 LAMP2P13473 410 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 NPR3P17342 541 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMA2P25787 234 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 PGFP49763 221 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC5A3P53794 718 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP26.88■■□□□ 1.894e-8■■■■■ 41.9
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CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 GJD3Q8N144 294 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 YIPF3Q9GZM5 350 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 OBSL1O75147 1896 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 DENND4CQ5VZ89 1909 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR91A4D1P6 747 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINB3P29508 390 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 BBS9Q3SYG4 887 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 LGSNQ5TDP6 509 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM154Q6P9G4 183 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D5Q6ZV89 423 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 C7orf26Q96N11 449 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF180Q9UJW8 692 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 CDH7Q9ULB5 785 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MCF2LO15068 1137 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MED7O43513 233 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 OVGP1Q12889 678 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ACSBG2Q5FVE4 666 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 RFWD3Q6PCD5 774 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 OTOP3Q7RTS5 596 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TMPRSS6Q8IU80 811 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP93Q8N1F7 819 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD52Q8NB46 1076 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC110Q8TBZ0 833 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MYRFLQ96LU7 910 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 MKS1Q9NXB0 559 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TAS2R1Q9NYW7 299 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 ATG16L1Q676U5 607 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC30A9Q6PML9 568 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 LRRC6Q86X45 466 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP26.86■■□□□ 1.89
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