RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220888.9

TRPS1-201, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRPS1, Length 5,480 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-201ENST00000220888 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 OLFM1Q99784 485 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 WDR27A2RRH5 827 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 H7C0S8 307 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 RASGRP1O95267 797 aa10.7□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 IL27RAQ6UWB1 636 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 SALL1Q9NSC2 1324 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 LRRC72A6NJI9 287 aa10.7□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 PRMT9Q6P2P2 845 aa10.7□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 HDDC3Q8N4P3 179 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 MYLPFQ96A32 169 aa10.7□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 CCT8L2Q96SF2 557 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 CPNE1Q99829 537 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 LMAN2LQ9H0V9 348 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 VIPAS39Q9H9C1 493 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 POLMQ9NP87 494 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 NDUFAF1Q9Y375 327 aa10.7□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 EID3Q8N140 333 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 ACTRT2Q8TDY3 377 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 KLQ9UEF7 1012 aa10.69□□□□□ -0.7
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TRPS1-201ENST00000220888 BNIPLQ7Z465 357 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
TRPS1-201ENST00000220888 TMEM134Q9H6X4 195 aa10.69□□□□□ -0.7
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