RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007264.6

RPUSD1-201, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene RPUSD1, Length 2,050 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1-201ENST00000007264 ABLIM3O94929 683 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 URODP06132 367 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 NEFHP12036 1026 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CSF2RAP15509 400 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 HARS2P49590 506 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNQ1P51787 676 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 LRRC26Q2I0M4 334 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PCMTD2Q9NV79 361 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PHTF1Q9UMS5 762 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 SOX13Q9UN79 622 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 EFCAB14O75071 495 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 TIMP1P01033 207 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 TACR2P21452 398 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 OR1E1P30953 314 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CCNFP41002 786 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 VEPH1Q14D04 833 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 TIFABQ6ZNK6 161 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 NDUFAF2Q8N183 169 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PLCD4Q9BRC7 762 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 FICDQ9BVA6 458 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 SPG21Q9NZD8 308 aa24.38■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 HMX2A2RU54 273 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ZNF840PA6NDX5 716 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 GJA8P48165 433 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 FRG1Q14331 258 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PARP15Q460N3 678 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 MARC1Q5VT66 337 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 SNX30Q5VWJ9 437 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 NADSYN1Q6IA69 706 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 FATE1Q969F0 183 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 MFSD3Q96ES6 412 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CPNE1Q99829 537 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CHRAC1Q9NRG0 131 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 STARD13Q9Y3M8 1113 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 YIPF1Q9Y548 306 aa24.37■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CARNS1A5YM72 827 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CCT8L1PA6NM43 557 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PMPCBO75439 489 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 RAG1P15918 1043 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 GP5P40197 560 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 MAPKAPK2P49137 400 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC11A2P49281 568 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ITKQ08881 620 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 LGI2Q8N0V4 545 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 MKS1Q9NXB0 559 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 J3KR12 359 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PRRG1O14668 218 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ELF1P32519 619 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ETV4P43268 484 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 WDR5P61964 334 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PDE1BQ01064 536 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PSMG2Q969U7 264 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 MANSC1Q9H8J5 431 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 NT5MQ9NPB1 228 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PSAT1Q9Y617 370 aa24.36■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ACSL4O60488 711 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 EDF1O60869 148 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 DHRS4L1P0CG22 281 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 MPP3Q13368 585 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 GRTP1Q5TC63 336 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHDC10Q6PID8 442 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CCDC63Q8NA47 563 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 SLC25A51Q9H1U9 297 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 KLHL14Q9P2G3 628 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PLLPQ9Y342 182 aa24.35■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 COCHO43405 550 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 GJB5O95377 273 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGA2BP08514 1039 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PLD1Q13393 1074 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PCID2Q5JVF3 399 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CGB2Q6NT52 195 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 KCNMB4Q86W47 210 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ACMSDQ8TDX5 336 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 YME1L1Q96TA2 773 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 KDM4CQ9H3R0 1056 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PEX11BO96011 259 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 ITGB8P26012 769 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CRHR1P34998 444 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 TMEM199Q8N511 208 aa24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RPUSD1-201ENST00000007264 CCT6BQ92526 530 aa24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms