RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171735.1

Nisch-221, Transcript of Nischarin, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 1,763 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gramd1aQ8VEF1 722 aa17.13■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr847Q8VFF4 312 aa17.13■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Msantd4Q91YU3 345 aa17.13■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc25a19Q9DAM5 318 aa17.13■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tsc1Q9EP53 1161 aa17.13■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cdc7Q9Z0H0 564 aa17.13■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Col12a1Q60847 3120 aa17.13■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vps13aQ5H8C4 3166 aa17.13■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 JrklB2RRL2 523 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Adgrf2E9Q4J9 644 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc149F6V035 524 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Fignl2J3QK54 644 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Vmn2r54K7N649 806 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ercc2O08811 760 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Plk2P53351 682 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ddr1Q03146 911 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Eri2Q5BKS4 688 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wee2Q66JT0 555 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 2700097O09RikQ6PGK3 301 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tdpoz4Q6YCH2 370 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tdpoz3Q717B4 365 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr1057Q7TR75 315 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc41a1Q8BJA2 512 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Heatr3Q8BQM4 679 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lrrc4cQ8C031 640 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Spata16Q8C636 571 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc17Q8CE13 565 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Aldh4a1Q8CHT0 562 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tfap2dQ91ZK0 452 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Aco2Q99KI0 780 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc86Q9JJ89 426 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 AspgA0JNU3 564 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Wdr95D3Z7A8 784 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kcnk16G5E845 292 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 DxoO70348 397 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Zfp42P22227 288 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mrps6P58064 125 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Grhl3Q5FWH3 603 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Hsf5Q5ND04 624 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mis18bp1Q80WQ8 998 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prr33Q8C494 260 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppp6r2Q8R3Q2 923 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dhcr24Q8VCH6 516 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Asz1Q8VD46 475 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Adgrf1Q8VEC3 908 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc25a3Q8VEM8 357 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Trem2Q99NH8 227 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gtf2ird2Q99NI3 936 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc124Q9D8X2 217 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tsga13Q9DA17 273 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 D7h11orf16Q9JJR6 402 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Bace2Q9JL18 514 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Asap1Q9QWY8 1147 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Spry1Q9QXV9 313 aa17.12■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tbc1d16A2ABG4 766 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tubb1A2AQ07 451 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Patl2A2ARM1 529 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Olfr414E9Q5P8 317 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 LifP09056 203 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cav1P49817 178 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Slc16a1P53986 493 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atp13a5Q3TYU2 1216 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Nudt18Q3U2V3 323 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Lsmem1Q3UQS2 128 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Prmt8Q6PAK3 394 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Efr3bQ6ZQ18 817 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Timm29Q8BGX2 266 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rccd1Q8BTU7 377 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc187Q8C5V8 958 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Brd8Q8R3B7 951 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Caap1Q8VDY9 356 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 TMEM121BQ99MX7 572 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Psma8Q9CWH6 250 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Dcp2Q9CYC6 422 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem59Q9QY73 323 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tk2Q9R088 270 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Sgk1Q9WVC6 431 aa17.11■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Chd7A2AJK6 2986 aaKnown RBP17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Igkv5-39A0A0G2JDV4 115 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 4933424G06RikA0A140LIP3 267 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kiaa1522A2A7S8 1013 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Atp8b4A2ANX3 1194 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Gm16430A6X8J1 155 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ccdc170D3YXL0 722 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ppp1r36D3Z0R2 411 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Casq2O09161 415 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Cyp4a14O35728 507 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Aff1O88573 1216 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Adrb1P34971 466 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mrgprx2Q3UG50 352 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Kctd19Q562E2 927 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Rxfp1Q6R6I7 758 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Tmem108Q8BHE4 574 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 MmaaQ8C7H1 415 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Ttc39cQ8VE09 580 aa17.1■□□□□ 0.33
Nisch-221ENSMUST00000171735 Mark1Q8VHJ5 795 aa17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 23.8 ms