RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000171404.7

Gtf3c4-204, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 4, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c4, Length 7,127 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2abC0HKE1 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2acC0HKE2 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2adC0HKE3 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2aeC0HKE4 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2agC0HKE5 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2aiC0HKE6 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2anC0HKE7 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2aoC0HKE8 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2apC0HKE9 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 JundP15066 341 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tgfb2P27090 414 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 AbrQ5SSL4 859 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rap1gap2Q5SVL6 712 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mapk10Q61831 464 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Nuak2Q8BZN4 639 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2ahQ8CGP6 128 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cdc73Q8JZM7 531 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 H2afjQ8R1M2 129 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Epsti1Q8VDI1 314 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 B3galt6Q91Z92 325 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Kremen1Q99N43 473 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rassf3Q99P51 232 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tube1Q9D6T1 475 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Lsm3P62311 102 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tbx2Q60707 711 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Naif1Q6PFD7 327 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gm5072A2AHM1 344 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Asna1O54984 348 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rab17P35292 214 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Grid2ipQ0QWG9 1203 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mrpl10Q3TBW2 262 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fscn1Q61553 493 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Nek3Q9R0A5 511 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Sae1Q9R1T2 350 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ddx43D3Z6P9 646 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Pcdh9F8VPK8 1237 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Sema6bO54951 886 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cyp2d9P11714 504 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gsta1P13745 223 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Irf8P23611 424 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Nat8lQ3UGX3 299 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 FdxrQ61578 494 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gsta1Q6P8Q0 223 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Rsbn1Q80T69 795 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 LnpepQ8C129 1025 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Bpifb9bA2AJD1 591 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 EnpepP16406 945 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Scp2P32020 547 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 H2-M3Q31093 336 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Zfp953Q3UPV7 304 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Ampd1Q3V1D3 745 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Shroom1Q5SX79 823 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Bpifb9aQ80XI7 591 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Plagl2Q925T4 496 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Lgr4A2ARI4 951 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 MrasO08989 208 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Aldh1a7O35945 501 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Aldh1a1P24549 501 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Itga3Q62470 1053 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cyp2r1Q6VVW9 501 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mindy1Q76LS9 468 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Vac14Q80WQ2 782 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Nudt8Q9CR24 210 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 CenpnQ9CZW2 337 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Fam45aQ9D8N2 357 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gsdmdc1Q9D8T2 487 aa16.07■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 FaahO08914 579 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 LipeP54310 759 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Msx2Q03358 267 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Unc93b1Q8VCW4 598 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Snai1Q02085 264 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mfn2Q80U63 757 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Asb2Q8K0L0 634 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Spag16Q8K450 639 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Bhmt2Q91WS4 363 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Dus2Q9D7B1 493 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 PtenO08586 403 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cops5O35864 334 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Il13ra2O88786 383 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 SPINDOCQ05AH6 381 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mrps15Q9DC71 258 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tmem59Q9QY73 323 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Prdm12A2AJ77 365 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 H2-Eb1P04230 264 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cyp2b10P12791 500 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Clec4fP70194 548 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Kcnq1P97414 668 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Glt6d1Q2NKH9 311 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 EtnpplQ8BWU8 499 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Cyp2j9Q924D1 502 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Tmem79Q9D709 391 aa16.06■□□□□ 0.16
Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 Mid2Q9QUS6 705 aa16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.8 ms