RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000066279.10

Sh3bp4-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp4, Length 4,995 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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