RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039061.14

Trappc11-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc11, Length 4,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mboat7Q8CHK3 473 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Fnbp1lQ8K012 605 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Hip1Q8VD75 1029 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Hipk3Q9ERH7 1192 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Prl2a1Q9JHK0 228 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Iigp1Q9QZ85 413 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vmn1r3A2AMT7 306 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Itih4A6X935 942 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vmn2r74E9PW21 853 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm6408J3QNG1 320 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Hmgb2P30681 210 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cct8P42932 548 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pdcd1Q02242 288 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cntn3Q07409 1028 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Fam83hQ148V8 1209 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Klrg2Q3UM83 387 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Plcl1Q3USB7 1096 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tnfaip2Q61333 691 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Armc12Q80X86 340 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Krr1Q8BGA5 380 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tyw1Q8BJM7 721 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vmn1r79Q8R285 306 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tdrd1Q99MV1 1172 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 DtnaQ9D2N4 746 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Noxred1Q9D3S5 366 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 B4galt5Q9JMK0 388 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Actl7aQ9QY84 440 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Psma4Q9R1P0 261 aa11.69□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dennd5bA2RSQ0 1274 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gbp4A4UUI3 631 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pgbd1E9Q492 415 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Wnt7bP28047 349 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gli1P47806 1111 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Coq7P97478 217 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gdf3Q07104 366 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Klra8Q60682 266 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 CcnhQ61458 323 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ifit3Q64345 403 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Q810S2 196 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ireb2Q811J3 963 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Fut11Q8BHC9 489 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gtf3c4Q8BMQ2 817 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 NaprtQ8CC86 538 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ugt2b34Q8K154 532 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cyp2c50Q91X77 490 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pkp2Q9CQ73 795 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Rhox9Q9EQM5 227 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ptk2bQ9QVP9 1009 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Zbtb18Q9WUK6 522 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Vmn2r72D3Z4N8 856 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dthd1E9PZX1 795 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Zc3h12bG3X9I7 835 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Hsdl2Q2TPA8 490 aaKnown RBP11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 HexdcQ3U4H6 486 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gprin1Q3UNH4 932 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mrm3Q5ND52 418 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dennd1cQ8CFK6 786 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ing3Q8VEK6 421 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 TcimQ9D915 106 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pold3Q9EQ28 462 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Trem1Q9JKE2 230 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 CpqQ9WVJ3 470 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Lzts3A2AHG0 700 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr456B2RT27 312 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ccdc85cE9Q6B2 420 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Aknad1E9Q8N6 675 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Abhd12bG3UZN6 359 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tnk2O54967 1055 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Morf4l1P60762 362 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Galnt10Q6P9S7 603 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 DstykQ6XUX1 927 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slc39a14Q75N73 489 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Snx32Q80ZJ7 404 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr458Q8VF80 313 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Olfr457Q8VGP5 313 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Pcdha1Q91Y21 948 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Anxa13Q99JG3 317 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Syvn1Q9DBY1 612 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Hmg20aQ9DC33 346 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Slc13a2Q9ES88 586 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gpc1Q9QZF2 557 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Psmd13Q9WVJ2 376 aa11.68□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 TazI7HJS2 263 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm8011K7N6Y5 207 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Dhx15O35286 795 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Hcn3O88705 779 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Apoa4P06728 395 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ass1P16460 412 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Wnt3aP27467 352 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Tfap2aP34056 437 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Mpp1P70290 466 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 TgfbiP82198 683 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 McuQ3UMR5 350 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Zfp953Q3UPV7 304 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Gm10392Q3V3I3 114 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Smpd4Q6ZPR5 823 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Teddm1aQ810U2 305 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Cept1Q8BGS7 416 aa11.67□□□□□ -0.54
Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ticam2Q8BJQ4 232 aa11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34.8 ms