RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr25P0C5I1 358 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc11a2P49282 568 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem165P52875 323 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrkcqQ02111 707 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Xlr3aQ60595 226 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stx3Q64704 289 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf821Q6PD05 413 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp759Q7M6X3 721 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phf24Q80TL4 400 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PisdQ8BSF4 406 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gbp9Q8BTS3 619 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsto2Q8K2Q2 248 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PompQ9CQT5 141 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q9D1Z2 194 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr711Q9EPG2 314 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tle2Q9WVB2 767 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4a12bA2A974 508 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bclaf3A2AG58 752 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ptar1E9QAB6 424 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3383J3QQ59 259 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psma2P49722 234 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pex2P55098 305 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Inpp5jP59644 1003 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam171bQ14CH0 825 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 March5Q3KNM2 278 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Esyt3Q5DTI8 891 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ltbp3Q61810 1268 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnajc6Q80TZ3 938 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q810S2 196 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Csnk1g1Q8BTH8 459 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atg16l1Q8C0J2 607 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr59Q8C0M0 992 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap29Q8CGF1 1266 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp4a12aQ91WL5 508 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gemin2Q9CQQ4 269 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PapolbQ9WVP6 641 aa12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Top3bQ9Z321 862 aaKnown RBP12.89□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef37A1IGU4 676 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Maml3D4QGC2 1135 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NoctO35710 429 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfm1O88998 485 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxb8P09632 243 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wbp2P97765 261 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sdr16c6Q05A13 316 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cpne7Q0VE82 557 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plcl1Q3USB7 1096 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim38Q5SZ99 471 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RbfaQ6P3B9 350 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scaf4Q6PFF0 1209 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ftsj1Q8CBC7 324 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hmgcll1Q8JZS7 343 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TraipQ8VIG6 470 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdhb6Q91XZ4 772 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tsga13Q9DA17 273 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmbim4Q9DA39 238 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap2b1Q9DBG3 937 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmp15Q9Z0L4 392 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Usp51B1AY15 661 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnk2O54967 1055 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccnb1P24860 430 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DazlQ64368 298 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bmt2Q8BXK4 403 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctxn3Q8BXZ0 80 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ifi205aQ8CGE8 404 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PlvapQ91VC4 438 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lpin1Q91ZP3 924 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim7Q923T7 510 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ecrg4Q99LS0 148 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PigxQ99LV7 254 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930513O06RikQ9D549 161 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Msh5Q9QUM7 833 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PtprfA2A8L5 1898 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf106O88466 1888 aa12.88□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts6D3Z1A5 1117 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 E230025N22RikG5E8S3 482 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp850J3QPC5 689 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgb1P09055 798 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Atxn1lP0C7T6 687 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rb1P13405 921 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dsc2P55292 902 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GaltQ03249 379 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GstcdQ5RL51 634 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tpp2Q64514 1262 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vwa2Q70UZ7 791 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc35f5Q8R314 524 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr784Q8VFZ9 319 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr348Q8VGK3 313 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sh3d19Q91X43 789 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SmtnQ921U8 923 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NonoQ99K48 473 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmd9Q9CR00 222 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlgap1Q9D415 992 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc23a1Q9Z2J0 605 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgef26D3YYY8 869 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc175E9PVB3 822 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd72P21855 354 aa12.87□□□□□ -0.35
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gsta3P30115 221 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35.5 ms