RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000019982.8

Gtf3c6-201, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c6, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gjb6P70689 261 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ttc39dQ0VF76 604 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Spata13Q5DU57 656 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ankrd40Q5SUE8 363 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Clec4a4Q5YIR8 236 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Stip1Q60864 543 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ndrg1Q62433 394 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dusp23Q6NT99 150 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Methig1Q76I26 264 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcg2Q7TMS5 657 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gpt2Q8BGT5 522 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nup93Q8BJ71 819 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q8C5C9 218 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 IntS13Q8QZV7 732 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ctage5Q8R311 779 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mlc1Q8VHK5 382 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TardbpQ921F2 414 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dpp3Q99KK7 738 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rmi1Q9D4G9 616 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 EtfbQ9DCW4 255 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc7a9Q9QXA6 487 aa11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Eif2s3xQ9Z0N1 472 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Adgrf5G5E8Q8 1348 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6685D3YYP3 228 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gcm2O09102 504 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ptpn9O35239 593 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SlkO54988 1233 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gdap1O88741 358 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pim1P06803 397 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ccnb1P24860 430 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Opa1P58281 960 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gabpb2P81069 414 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Npy2rP97295 381 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zscan2Q07230 614 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cyp2j11Q3UNV2 504 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fzd3Q61086 666 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nxph1Q61200 271 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 FdxrQ61578 494 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 HpseQ6YGZ1 535 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srrm3Q80WV7 648 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Iars2Q8BIJ6 1012 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klf8Q8BLM0 355 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Anapc2Q8BZQ7 837 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmem145Q8C4U2 746 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Commd10Q8JZY2 202 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx18Q8K363 660 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Znf131Q8K3J5 619 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Olfr847Q8VFF4 312 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Lrrc26Q91W20 331 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Serpina3nQ91WP6 418 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Zfp810Q99K45 461 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Fam212aQ9CX62 282 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 D930007J09RikQ9D2K6 131 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Arl13aQ9D416 372 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Strn3Q9ERG2 796 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Il17bQ9QXT6 180 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mapk9Q9WTU6 423 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sdk2Q6V4S5 2176 aa11.43□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Srp54bE9PXC0 504 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm14496K7N5U4 849 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vmn2r8L7N472 848 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tgfbr3O88393 850 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cdh1P09803 884 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ly6fP35460 134 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Sox5P35710 763 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Klk1b26P36369 261 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nr2c2P49117 596 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SmoP56726 793 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Psmb7P70195 277 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cd300lgQ1ERP8 331 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mns1Q61884 491 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 RhocQ62159 193 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Ddx51Q6P9R1 639 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Igsf3Q6ZQA6 1194 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tdpoz3Q717B4 365 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmc6Q7TN60 810 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Q80Y73 168 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Gm6377Q8BHV4 303 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dars2Q8BIP0 653 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tmx3Q8BXZ1 456 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Rab43Q8CG50 210 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tph2Q8CGV2 488 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Prpf39Q8K2Z2 665 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 TmieQ8K467 153 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Mrps18cQ8R2L5 143 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nup58Q8R332 587 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Cpa5Q8R4H4 436 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Dkk4Q8VEJ3 221 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Creb3l3Q91XE9 479 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Tfap2dQ91ZK0 452 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Pycr1Q922W5 309 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 SrrtQ99MR6 875 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Vps28Q9D1C8 221 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Reg4Q9D8G5 157 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Slc25a19Q9DAM5 318 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Abcg8Q9DBM0 673 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Nek3Q9R0A5 511 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 Enpp2Q9R1E6 862 aa11.42□□□□□ -0.58
Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 CpqQ9WVJ3 470 aa11.42□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.1 ms