RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628018.2

CAPNS1-215, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-215ENST00000628018 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 APRTP07741 180 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 WEE1P30291 646 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 IL10RBQ08334 325 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF77Q15935 545 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 GPR149Q86SP6 731 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 IQCKQ8N0W5 287 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 GBA3Q9H227 469 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 SEMA4AQ9H3S1 761 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 RHOCP08134 193 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 USP4Q13107 963 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CBLBQ13191 982 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 HIF1AQ16665 826 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 MPPE1Q53F39 396 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 SYCP2LQ5T4T6 812 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ANKRD54Q6NXT1 300 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 MCUQ8NE86 351 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 USP33Q8TEY7 942 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 GORASP1Q9BQQ3 440 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 EPB41L4BQ9H329 900 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 SP110Q9HB58 689 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 LMCD1Q9NZU5 365 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 E7EVH7 732 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CACNG3O60359 315 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ARL4CP56559 192 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 FNBP1LQ5T0N5 605 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 MPP7Q5T2T1 576 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CFAP58Q5T655 872 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ALS2CLQ60I27 953 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 SYCE2Q6PIF2 218 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF783Q6ZMS7 281 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CENPUQ71F23 418 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF354CQ86Y25 554 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 RSPH14Q9UHP6 348 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 E7ESA3 106 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 PRAMEF11O60813 436 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 NFKB1P19838 968 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CDK16Q00536 496 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 LRIT3Q3SXY7 679 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF43Q68DV7 783 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 CARNMT1Q8N4J0 409 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 OR7D4Q8NG98 312 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 PDFQ9HBH1 243 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 F5H423 210 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 FSHRP23945 695 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 MAGEA4P43358 317 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 RENBPP51606 427 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 TNK2Q07912 1038 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ADAM15Q13444 863 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 PDIK1LQ8N165 341 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 TEX26Q8N6G2 289 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 DDI1Q8WTU0 396 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 SERPINB12Q96P63 405 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ZIM3Q96PE6 472 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 APOL5Q9BWW9 433 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 KIF9Q9HAQ2 790 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 SAYSD1Q9NPB0 183 aa25.39■■□□□ 1.66
CAPNS1-215ENST00000628018 H0Y626 953 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 ALOX15BO15296 676 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 RIPK2O43353 540 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 KDELR3O43731 214 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 HLA-DQB2P05538 268 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 IFNAR2P48551 515 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 SLC10A7Q0GE19 358 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 MSS51Q4VC12 460 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 FSCBQ5H9T9 825 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 IL31Q6EBC2 164 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 NPAS3Q8IXF0 933 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 ZNF599Q96NL3 588 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 GLOD4Q9HC38 313 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 TBC1D14Q9P2M4 693 aa25.38■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 GOLGA6BA6NDN3 693 aa25.37■■□□□ 1.65
CAPNS1-215ENST00000628018 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
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