RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592408.5

EFTUD2-222, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 4

Gene EFTUD2, Length 561 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-222ENST00000592408 LCA5Q86VQ0 697 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ZNF567Q8N184 647 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PYROXD2Q8N2H3 581 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MPP5Q8N3R9 675 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 STMN2Q93045 179 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CERS2Q96G23 380 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PRDM12Q9H4Q4 367 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PLAC1Q9HBJ0 212 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 BATF3Q9NR55 127 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SMYD2Q9NRG4 433 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PIGVQ9NUD9 493 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DDIT4Q9NX09 232 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SYBUQ9NX95 663 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 FBXW11Q9UKB1 542 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GJD2Q9UKL4 321 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 VANGL2Q9ULK5 521 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 HRH3Q9Y5N1 445 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CDY2AQ9Y6F7 541 aa9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP9.41□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 VGLL3A8MV65 326 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CLDN5O00501 218 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TPP1O14773 563 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ANP32DO95626 131 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ITGA2BP08514 1039 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 T-ENOLP0DO92 83 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 RARBP10826 455 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MYL4P12829 197 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ERCC2P18074 760 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPN3P26045 913 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 EPHB2P29323 1055 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ELF1P32519 619 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 HK2P52789 917 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PRKAA2P54646 552 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 BEX3Q00994 111 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TSPY1Q01534 308 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GALNT2Q10471 571 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SEMA3BQ13214 749 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 UGP2Q16851 508 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MFSD14CQ5VZR4 134 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 BSPRYQ5W0U4 402 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 THEM5Q8N1Q8 247 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAAF3Q8N9W5 541 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ARRDC4Q8NCT1 418 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM13CQ8NE31 585 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 MYLPFQ96A32 169 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ISL2Q96A47 359 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PTPN18Q99952 460 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 IL22Q9GZX6 179 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 GPAMQ9HCL2 828 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CASS4Q9NQ75 786 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 CRTAC1Q9NQ79 661 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 KANSL3Q9P2N6 904 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 STOML1Q9UBI4 398 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa9.4□□□□□ -0.9
EFTUD2-222ENST00000592408 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 A8MUI8 341 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TMEM114B3SHH9 223 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 UGT1A9O60656 530 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PLIN3O60664 434 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ANXA9O76027 345 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 KLHL2O95198 593 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SERPINA6P08185 405 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CYP2B6P20813 491 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 DNAJB1P25685 340 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 TYK2P29597 1187 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CXCR3P49682 368 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 LIMK2P53671 638 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 AQP5P55064 265 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 ASPHQ12797 758 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 GRIK3Q13003 919 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CCDC6Q16204 474 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 BRMS1LQ5PSV4 323 aa9.39□□□□□ -0.91
EFTUD2-222ENST00000592408 SYPL2Q5VXT5 272 aa9.39□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms