RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583841.1

TSPOAP1-AS1-210, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene TSPOAP1-AS1, Length 840 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HPCAL4Q9UM19 191 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SAR1BQ9Y6B6 198 aa16.05■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 A0A0A0MRY4 1105 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KANSL1LA0AUZ9 987 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STK25O00506 426 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KDELR3O43731 214 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 APOC2P02655 101 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TARSP26639 723 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TNFRSF4P43489 277 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ECT2LQ008S8 904 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EIF4HQ15056 248 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LONRF2Q1L5Z9 754 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EMC10Q5UCC4 262 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LINGO4Q6UY18 593 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LEKR1Q6ZMV7 388 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATPAF2Q8N5M1 289 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ACTL9Q8TC94 416 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TTC17Q96AE7 1141 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CAPZA3Q96KX2 299 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SP110Q9HB58 689 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LTB4R2Q9NPC1 389 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZDHHC4Q9NPG8 344 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ELOVL2Q9NXB9 296 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ESPNB1AK53 854 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 J3KR12 359 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CES2O00748 559 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATP5BP06576 529 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ALADP13716 330 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRLRP16471 622 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MX2P20592 715 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 GARSP41250 739 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NR2C2P49116 596 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ARF5P84085 180 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SULT2A1Q06520 285 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCINQ13939 588 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NOMO1Q15155 1222 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TRIM67Q6ZTA4 783 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CCNYQ8ND76 341 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 UCMAQ8WVF2 138 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ACDQ96AP0 544 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 OLFM3Q96PB7 478 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MFSD1Q9H3U5 465 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SLC25A13Q9UJS0 675 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ERVW-1Q9UQF0 538 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ACTL7AQ9Y615 435 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RAD54BQ9Y620 910 aa16.03■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FAM170BA6NMN3 283 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TIMM44O43615 452 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MAFKO60675 156 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PRAMEF11O60813 436 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RNF40O75150 1001 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZMPSTE24O75844 475 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TUBB4AP04350 444 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ASLP04424 464 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 DLDP09622 509 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 TIE1P35590 1138 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDK1Q15118 436 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 C2orf27AQ580R0 203 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 RETSATQ6NUM9 610 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF687Q8N1G0 1237 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FLCNQ8NFG4 579 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LGMNQ99538 433 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDFQ9HBH1 243 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 HCN2Q9UL51 889 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PLA2G4CQ9UP65 541 aa16.02■□□□□ 0.16
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MCF2LO15068 1137 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 NCAM2O15394 837 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 MT-CO1P00395 513 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 CHRNB1P11230 501 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 EIF3EP60228 445 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 IL10RBQ08334 325 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 AP1B1Q10567 949 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRRC32Q14392 662 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ZNF234Q14588 700 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 PTPRNQ16849 979 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 LRRC49Q8IUZ0 686 aa16.01■□□□□ 0.15
TSPOAP1-AS1-210ENST00000583841 ATP11CQ8NB49 1132 aa16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.1 ms