RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580646.5

GGA3-209, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 829 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-209ENST00000580646 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 NLRP14Q86W24 1093 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 CFAP52Q8N1V2 620 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 CARNMT1Q8N4J0 409 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 FRMD1Q8N878 549 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 TPCN2Q8NHX9 752 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 UCMAQ8WVF2 138 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 RTKNQ9BST9 563 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 DESI2Q9BSY9 194 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 LACRTQ9GZZ8 138 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 SMOC1Q9H4F8 434 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 ZWILCHQ9H900 591 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 CD248Q9HCU0 757 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 VPS45Q9NRW7 570 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 ELOVL2Q9NXB9 296 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 THAP10Q9P2Z0 257 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 PCSK1NQ9UHG2 260 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 GGA2Q9UJY4 613 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 RAD54BQ9Y620 910 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 STON1Q9Y6Q2 735 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 PKD1L2Q7Z442 2459 aa10.15□□□□□ -0.78
GGA3-209ENST00000580646 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ILVBLA1L0T0 632 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 DCDC2BA2VCK2 349 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 FAM72CH0Y354 149 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 DYNC1I1O14576 645 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 SLC30A4O14863 429 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 PSTPIP1O43586 416 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 SRGAP2O75044 1071 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 CNTN5O94779 1100 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 MOCS3O95396 460 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ASLP04424 464 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 PTMAP06454 111 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 RARAP10276 462 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 TCF4P15884 667 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ETFBP38117 255 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 GGCXP38435 758 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 IRAK1P51617 712 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ARSEP51690 589 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 TPI1P60174 286 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 SULT2A1Q06520 285 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 LMAN2Q12907 356 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ENPP2Q13822 863 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 PDK2Q15119 407 aa10.14□□□□□ -0.79
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GGA3-209ENST00000580646 ALFQ53S48 1182 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 FAM72AQ5TYM5 149 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 FAM72DQ6L9T8 149 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 KIAA1211LQ6NV74 962 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 LPCAT2Q7L5N7 544 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ADIPOR2Q86V24 386 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 FAM72BQ86X60 149 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 RHOT1Q8IXI2 618 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 SYCE1Q8N0S2 351 aa10.14□□□□□ -0.79
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GGA3-209ENST00000580646 TTC17Q96AE7 1141 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ERLEC1Q96DZ1 483 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa10.14□□□□□ -0.79
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GGA3-209ENST00000580646 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.14□□□□□ -0.79
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GGA3-209ENST00000580646 SNX10Q9Y5X0 201 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ALG6Q9Y672 507 aa10.14□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ACACBO00763 2458 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 H3BRJ5 948 aa10.13□□□□□ -0.79
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GGA3-209ENST00000580646 NDUFV2P19404 249 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 COMTP21964 271 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 EPHB2P29323 1055 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 OR1E1P30953 314 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 CD70P32970 193 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ARL4AP40617 200 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 IL12RB1P42701 662 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 LIMK1P53667 647 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 TAS2R40P59535 323 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 DPYSQ14117 519 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 ZNF234Q14588 700 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 STARD3Q14849 445 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 CA9Q16790 459 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 SMTNL2Q2TAL5 461 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 FSCBQ5H9T9 825 aa10.13□□□□□ -0.79
GGA3-209ENST00000580646 PITRM1Q5JRX3 1037 aa10.13□□□□□ -0.79
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