RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570063.5

RSRP1-222, Transcript of arginine and serine rich protein 1, human

TSL 5

Gene RSRP1, Length 1,821 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RSRP1-222	ENST00000570063	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	PSMD5	Q16401	504 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	PRSS55	Q6UWB4	352 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	LRRC49	Q8IUZ0	686 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	UMODL1-AS1	Q8N2C9	162 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TTPAL	Q9BTX7	342 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	HIPK3	Q9H422	1215 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TLR8	Q9NR97	1041 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	USH1C	Q9Y6N9	552 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	COL4A6	Q14031	1691 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ADAM12	O43184	909 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	HLA-DQB2	P05538	268 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ITGA2B	P08514	1039 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	RHOQ	P17081	205 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ADRA1A	P35348	466 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	GP5	P40197	560 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	CCL23	P55773	120 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	DUSP4	Q13115	394 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	CES4A	Q5XG92	561 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ISL2	Q96A47	359 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MFSD3	Q96ES6	412 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	CPNE1	Q99829	537 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	IL22	Q9GZX6	179 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MARCH2	Q9P0N8	246 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ZFAT	Q9P243	1243 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF212	Q9UDV6	495 aa		18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	18.16	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MAGEB16	A2A368	324 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TPP1	O14773	563 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ATP9B	O43861	1147 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	CNTN5	O94779	1100 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MT-CYB	P00156	380 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	GSR	P00390	522 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MYC	P01106	439 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TPH1	P17752	444 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ATF6	P18850	670 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	NDST2	P52849	883 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	CDH17	Q12864	832 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ALF	Q53S48	1182 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	LINC00523	Q86TU6	105 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	PACS2	Q86VP3	889 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	RNF168	Q8IYW5	571 aa	Predicted RBP	18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	LRRC43	Q8N309	656 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ATP6V0D2	Q8N8Y2	350 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ZNF398	Q8TD17	642 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	FATE1	Q969F0	183 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MECR	Q9BV79	373 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	KIFC1	Q9BW19	673 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TTLL2	Q9BWV7	592 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	VN1R3	Q9BXE9	311 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	EMCN	Q9ULC0	261 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	CHKB	Q9Y259	395 aa		18.15	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	DOCK4	Q8N1I0	1966 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	AP3B1	O00203	1094 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	DNAJB2	P25686	324 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	MAGEA12	P43365	314 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	NCALD	P61601	193 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	STXBP5	Q5T5C0	1151 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	GRTP1	Q5TC63	336 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	IGSF8	Q969P0	613 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	VWCE	Q96DN2	955 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	IPO11	Q9UI26	975 aa	Known RBP	18.14	■□□□□ 0.5
RSRP1-222	ENST00000570063	DRGX	A6NNA5	263 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	SLC38A8	A6NNN8	435 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	RASSF9	O75901	435 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	ANXA9	O76027	345 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	NMBR	P28336	390 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	C10orf120	Q5SQS8	335 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	SLC8B1	Q6J4K2	584 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	FBXL22	Q6P050	247 aa		18.14	■□□□□ 0.49
RSRP1-222	ENST00000570063	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		18.14	■□□□□ 0.49

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms