RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569151.1

BBS4-216, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 4, human

TSL 3

Gene BBS4, Length 272 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS4-216	ENST00000569151	MXRA8	Q9BRK3	442 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	MECR	Q9BV79	373 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	RPF2	Q9H7B2	306 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ANKH	Q9HCJ1	492 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	SLC9A2	Q9UBY0	812 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	GGA1	Q9UJY5	639 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	TRIM17	Q9Y577	477 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	MYH14	Q7Z406	1995 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	LTBP1	Q14766	1721 aa		4.69	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	HMX2	A2RU54	273 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	SLC35F4	A4IF30	521 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	WTIP	A6NIX2	430 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	AQP12B	A6NM10	295 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	BBIP1	A8MTZ0	92 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	WDR64	B1ANS9	1081 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	FAM47E-STBD1	D6RA91	191 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151		H3BMQ9	156 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	GOLGA8S	H3BPF8	625 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	GOLGA8M	H3BSY2	632 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	RGS13	O14921	159 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	PFDN6	O15212	129 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	HTRA2	O43464	458 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	MED7	O43513	233 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	DCX	O43602	365 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ZBTB14	O43829	449 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	LRCH4	O75427	683 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	BANF1	O75531	89 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	TOM1L1	O75674	476 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	RSL1D1	O76021	490 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	NDUFB10	O96000	172 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	MPO	P05164	745 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	GSTT2	P0CG29	244 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	GSTT2B	P0CG30	244 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	CSH1	P0DML2	217 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	CSH2	P0DML3	217 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	XRCC1	P18887	633 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	GJC1	P36383	396 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	GP5	P40197	560 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	NPTX2	P47972	431 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	POLD2	P49005	469 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	NR2C2	P49116	596 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	NUDT2	P50583	147 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	HLCS	P50747	726 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ATP4B	P51164	291 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	HSD17B4	P51659	736 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	NDST2	P52849	883 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	CSE1L	P55060	971 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ARPC4	P59998	168 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	KRT76	Q01546	638 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	NSUN2	Q08J23	767 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	BNIP2	Q12982	314 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	PRKAA1	Q13131	559 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	STX5	Q13190	355 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	SEMA5A	Q13591	1074 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	PPP2R5D	Q14738	602 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ZNF846	Q147U1	533 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	SURF1	Q15526	300 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	GRIK5	Q16478	980 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	CRY2	Q49AN0	593 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	SAMD4B	Q5PRF9	694 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ZFYVE27	Q5T4F4	411 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	C16orf87	Q6PH81	154 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	OLFML1	Q6UWY5	402 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	UNC5A	Q6ZN44	842 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	CAND1	Q86VP6	1230 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
BBS4-216	ENST00000569151	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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