RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567479.1

KIFC3-231, Transcript of kinesin family member C3, human

TSL 4

Gene KIFC3, Length 534 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KIFC3-231	ENST00000567479	ZYG11B	Q9C0D3	744 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	HSD3B7	Q9H2F3	369 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	IL21R	Q9HBE5	538 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TM7SF3	Q9NS93	570 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SNX11	Q9Y5W9	270 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		9.64	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SPTBN2	O15020	2390 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ILVBL	A1L0T0	632 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	C2CD4B	A6NLJ0	364 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNK3	O14649	394 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ALOX15B	O15296	676 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SNAP91	O60641	907 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	MT-CO1	P00395	513 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CALB1	P05937	261 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SRC	P12931	536 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ATP1A3	P13637	1013 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FER	P16591	822 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PTPN9	P43378	593 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CCR5	P51681	352 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	C21orf59	P57076	290 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM193A	P78312	1265 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC20A2	Q08357	652 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PTP4A2	Q12974	167 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CDO1	Q16878	200 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CLEC16A	Q2KHT3	1053 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FILIP1L	Q4L180	1135 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF783	Q6ZMS7	281 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DBX2	Q6ZNG2	339 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479		Q6ZVU0	165 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	STRADA	Q7RTN6	431 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SETD7	Q8WTS6	366 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC114	Q96M63	670 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SPON2	Q9BUD6	331 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	OSBPL2	Q9H1P3	480 aa		9.63	□□□□□ -0.87
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KIFC3-231	ENST00000567479	TPX2	Q9ULW0	747 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		9.63	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	9.63	□□□□□ -0.87
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KIFC3-231	ENST00000567479	ANKRD62	A6NC57	917 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SIGLEC16	A6NMB1	481 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479		K7ERQ8	282 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CBX4	O00257	560 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PLK4	O00444	970 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	VILL	O15195	856 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SLC7A4	O43246	635 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TEX33	O43247	280 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DFNA5	O60443	496 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RTN2	O75298	545 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TRIM16	O95361	564 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	GJB6	O95452	261 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TOP3B	O95985	862 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	SPINK2	P20155	84 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	TNFAIP3	P21580	790 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	GPD1	P21695	349 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CD38	P28907	300 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CHRNA3	P32297	505 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DRD3	P35462	400 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CLCN6	P51797	869 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ADPRH	P54922	357 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ZNF423	Q2M1K9	1284 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RAB6C	Q53S08	254 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	ACAD10	Q6JQN1	1059 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	WDR59	Q6PJI9	974 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	LINGO4	Q6UY18	593 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	C3orf20	Q8ND61	904 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	OR7D4	Q8NG98	312 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	OR2A12	Q8NGT7	310 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	RHBDD1	Q8TEB9	315 aa		9.62	□□□□□ -0.87
KIFC3-231	ENST00000567479	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		9.62	□□□□□ -0.87

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