RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563951.1

CCDC33-211, Transcript of coiled-coil domain containing 33, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC33, Length 308 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC33-211ENST00000563951 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 LRRC31Q6UY01 552 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 LINGO4Q6UY18 593 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 Q6ZVU0 165 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SETD3Q86TU7 594 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 VPS36Q86VN1 386 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TMPRSS6Q8IU80 811 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 STK40Q8N2I9 435 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 NIPA2Q8N8Q9 360 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 FAM129BQ96TA1 746 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 MUC3BQ9H195 1237 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 NCDNQ9UBB6 729 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PCSK1NQ9UHG2 260 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PLA2G4CQ9UP65 541 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 AP4E1Q9UPM8 1137 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 HS3ST2Q9Y278 367 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PCDH15Q96QU1 1955 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 WASH4PA8MWX3 477 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 MOCS3O95396 460 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 CTSLP07711 333 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 OR1E1P30953 314 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PCK1P35558 622 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 MAPKAPK2P49137 400 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TPMTP51580 245 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 AIF1P55008 147 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 OXCT1P55809 520 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TAS2R40P59535 323 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SULT2A1Q06520 285 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 C6orf118Q5T5N4 469 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TCEAL6Q6IPX3 200 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ARMCX6Q7L4S7 300 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 CNGA4Q8IV77 575 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TMEFF1Q8IYR6 380 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PGBD3Q8N328 593 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 AADATQ8N5Z0 425 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 DEFB119Q8N690 84 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 NPWQ8N729 165 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 NETO2Q8NC67 525 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TCEAL3Q969E4 200 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 FAM131CQ96AQ9 280 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SIPA1Q96FS4 1042 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 HMCESQ96FZ2 354 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TOE1Q96GM8 510 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 LOXL4Q96JB6 756 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SPACA7Q96KW9 195 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ITM2CQ9NQX7 267 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 RXFP3Q9NSD7 469 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 DNAI1Q9UI46 699 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ANAPC7Q9UJX3 599 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 GMEB2Q9UKD1 530 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 KNL1Q8NG31 2342 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PATE3B3GLJ2 98 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PLK4O00444 970 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 CREB3O43889 395 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ZNF217O75362 1048 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 H2AFZP0C0S5 128 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 TMEM253P0C7T8 217 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 RARAP10276 462 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 GOT1P17174 413 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ITPKAP23677 461 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 EPHB2P29323 1055 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 CD6P30203 668 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 DRD3P35462 400 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 MPLP40238 635 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 PSMD8P48556 350 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ARSEP51690 589 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ST8SIA6P61647 398 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 DPYSQ14117 519 aa8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
CCDC33-211ENST00000563951 DLG2Q15700 870 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms