RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558534.5

RABGGTA-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTA, Length 753 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-205ENST00000558534 TMTC1Q8IUR5 882 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SH2D3CQ8N5H7 860 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 LZTR1Q8N653 840 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 TC2NQ8N9U0 490 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ATP11CQ8NB49 1132 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SPON2Q9BUD6 331 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 PCSK1NQ9UHG2 260 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa16.17■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 NUP205Q92621 2012 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ANTXRLA6NF34 631 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 H3BRJ5 948 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 CBX4O00257 560 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SIN3BO75182 1162 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 IGLV3-19P01714 112 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT7P08729 469 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 MAN1A1P33908 653 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 IRAK1P51617 712 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 NDST2P52849 883 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SEMA3BQ13214 749 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP2U1Q7Z449 544 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 MAP7D3Q8IWC1 876 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 CADM4Q8NFZ8 388 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 MYO19Q96H55 970 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 RPL10LQ96L21 214 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SGK2Q9HBY8 427 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF212Q9UDV6 495 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS51Q9UID3 782 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 CYP8B1Q9UNU6 501 aa16.16■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP42A6NI28 874 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 TTC34A8MYJ7 566 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 C5AR1P21730 350 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINB6P35237 376 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SSR1P43307 286 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 TPMTP51580 245 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 DLG2Q15700 870 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 DPYSL2Q16555 572 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB6CQ53S08 254 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 WDR45BQ5MNZ6 344 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 LYSMD4Q5XG99 296 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 USP34Q70CQ2 3546 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 GAS2L3Q86XJ1 694 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 RFFLQ8WZ73 363 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 CHP1Q99653 195 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 BTBD1Q9H0C5 482 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 RAB6CQ9H0N0 254 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 VPS45Q9NRW7 570 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SUSD2Q9UGT4 822 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAI1Q9UI46 699 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 FZD4Q9ULV1 537 aa16.15■□□□□ 0.18
RABGGTA-205ENST00000558534 A0A0D9SEW6 157 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM72CH0Y354 149 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PROSCO94903 275 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SRCP12931 536 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SLC1A1P43005 524 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 STK19P49842 368 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 SERPINH1P50454 418 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 RPS14P62263 151 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGAP8P85298 464 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 LMNB2Q03252 620 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 KRT81Q14533 505 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 CST6Q15828 149 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 CSRP2Q16527 193 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 LPAL2Q16609 132 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ODF2Q5BJF6 829 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 C9orf64Q5T6V5 341 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM72AQ5TYM5 149 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM72DQ6L9T8 149 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 RFX8Q6ZV50 586 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 FAM72BQ86X60 149 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 DNAAF5Q86Y56 855 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PLPP6Q8IY26 295 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PYROXD2Q8N2H3 581 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ZNF366Q8N895 744 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 CEP76Q8TAP6 659 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 GANCQ8TET4 914 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 RLN3Q8WXF3 142 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 ARHGEF26Q96DR7 871 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PPP1R16AQ96I34 528 aa16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-205ENST00000558534 PSMB7Q99436 277 aa16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.5 ms