RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552346.1

USP15-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 655 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-218ENST00000552346 NPIPB13A6NJU9 1138 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 LINC01548A6NM66 108 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 NPIPB5A8MRT5 1133 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 NPIPB4C9JG80 1138 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TNFSF14O43557 240 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 CCNDBP1O95273 360 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 AVPR2P30518 371 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 HNF1BP35680 557 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 DIO1P49895 249 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 RPS6KA3P51812 740 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 JAK3P52333 1124 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 GPC5P78333 572 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ARHGAP8P85298 464 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TDGQ13569 410 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ACVR2BQ13705 512 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 KLHL24Q6TFL4 600 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SFTPA1Q8IWL2 248 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 LAS2Q8IYD9 372 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 HTATIP2Q9BUP3 242 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 BRF2Q9HAW0 419 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SNX15Q9NRS6 342 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 KLQ9UEF7 1012 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SARDHQ9UL12 918 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 FZD4Q9ULV1 537 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PASKQ96RG2 1323 aa5.67□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 A0A1W2PQM1 296 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 AP3D1O14617 1153 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PRAMEF2O60811 474 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 KAT7O95251 611 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 URODP06132 367 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PRR35P0CG20 571 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 COX7A2P14406 83 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PORP16435 677 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 BSGP35613 385 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 HARS2P49590 506 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 RARSP54136 660 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TFF2Q03403 129 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 NAA25Q14CX7 972 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 RILPL1Q5EBL4 403 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TMEM63BQ5T3F8 832 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ZNF626Q68DY1 528 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 NCSTNQ92542 709 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 KAZALD1Q96I82 304 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 CTDSP1Q9GZU7 261 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ARHGEF3Q9NR81 526 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SERTAD4Q9NUC0 356 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 VPS4AQ9UN37 437 aa5.66□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 B4DLN1 442 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TP73O15350 636 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TGFB1I1O43294 461 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TTLL1O95922 423 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 LYL1P12980 280 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 AKR1B1P15121 316 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PRPH2P23942 346 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PCSK6P29122 969 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TM4SF1P30408 202 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 GALNSP34059 522 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PTGER1P34995 402 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 KRT20P35900 424 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 AGTR2P50052 363 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 UFM1P61960 85 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PSG6Q00889 435 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 CREB5Q02930 508 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 CFHR3Q02985 330 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 LMAN2Q12907 356 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 WTAPQ15007 396 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 TMEM119Q4V9L6 283 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 PLAC9Q5JTB6 97 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 MFSD4BQ5TF39 518 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SUMO4Q6EEV6 95 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 C11orf87Q6NUJ2 197 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 KRT74Q7RTS7 529 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 ANKRD23Q86SG2 305 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 MON1AQ86VX9 555 aa5.65□□□□□ -1.5
USP15-218ENST00000552346 SCN4BQ8IWT1 228 aa5.65□□□□□ -1.5
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