RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 PPP3CAQ08209 521 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 FGL2Q14314 439 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ZFAND4Q86XD8 727 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 FBXO39Q8N4B4 442 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 UBA3Q8TBC4 463 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CLEC4CQ8WTT0 213 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 FOXP3Q9BZS1 431 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 EPB41L5Q9HCM4 733 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PREBQ9HCU5 417 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ABCC13Q9NSE7 274 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PLAAQ9Y263 795 aa14.07□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 KRT38O76015 456 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 NME1P15531 152 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 HNRNPA2B1P22626 353 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 AKT2P31751 481 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 AFMP43652 599 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CCR10P46092 362 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 DAOAP59103 153 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 NR0B2Q15466 257 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 MANEAQ5SRI9 462 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 NUGGCQ68CJ6 796 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CNNM4Q6P4Q7 775 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 Q6ZVU0 165 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 UNC13DQ70J99 1090 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 RAB11FIP2Q7L804 512 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 HORMAD1Q86X24 394 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CIR1Q86X95 450 aaPredicted RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 RBFAQ8N0V3 343 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TMC2Q8TDI7 906 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LMX1AQ8TE12 382 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 OR8D1Q8WZ84 308 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SEMA4DQ92854 862 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 AZIN2Q96A70 460 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 DHX58Q96C10 678 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 IFT43Q96FT9 208 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 BOCQ9BWV1 1114 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LRRC4Q9HBW1 653 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CISHQ9NSE2 258 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 FOXJ2Q9P0K8 574 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CACNA1DQ01668 2161 aa14.06□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ENO4A6NNW6 628 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 AQP9O43315 295 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 BNIP3LO60238 219 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 GCATO75600 419 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 MOCS3O95396 460 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 FYNP06241 537 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LCP1P13796 627 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PDGFRAP16234 1089 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ITIH1P19827 911 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 ETV5P41161 510 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CASRP41180 1078 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 C1orf61Q13536 156 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SPIDRQ14159 915 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 FAM46CQ5VWP2 391 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 UNC45BQ8IWX7 931 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LGI2Q8N0V4 545 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 OR52K2Q8NGK3 314 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 USP28Q96RU2 1077 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 MMRN2Q9H8L6 949 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PISDQ9UG56 409 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TRPM6Q9BX84 2022 aa14.05□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 CENPEQ02224 2701 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 A6NNZ2 444 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 IKBKBO14920 756 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 PRAMEF10O60809 474 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 NR3C1P04150 777 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 MORC3Q14149 939 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 RAP1GAP2Q684P5 730 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.04□□□□□ -0.16
CS-230ENST00000551968 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms