RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515802.5

SH3BP2-229, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,247 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-229ENST00000515802 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 HIPK3Q9H422 1215 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 MTPAPQ9NVV4 582 aaKnown RBP eCLIP15.38■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 CAPN7Q9Y6W3 813 aa15.38■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 HOXA2O43364 376 aa15.37■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 PACS1Q6VY07 963 aa15.37■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.37■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP15.37■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa15.37■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 COL4A6Q14031 1691 aa15.37■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa15.36■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 ATF6P18850 670 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 PRPSAP1Q14558 356 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 GALNTL6Q49A17 601 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 C10orf120Q5SQS8 335 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa15.35■□□□□ 0.05
SH3BP2-229ENST00000515802 MFSD3Q96ES6 412 aa15.35■□□□□ 0.05
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SH3BP2-229ENST00000515802 RNF208Q9H0X6 261 aa15.35■□□□□ 0.05
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