RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514402.1

MATR3-223, Transcript of matrin 3, human

TSL 2

Gene MATR3, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	NPIPB13	A6NJU9	1138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	OR6C75	A6NL08	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	NPIPB5	A8MRT5	1133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	NPIPB4	C9JG80	1138 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402		F5H423	210 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	SPRY3	O43610	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	KLRC2	P26717	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	TNFSF8	P32971	234 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	RPS6KA3	P51812	740 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	ZP1	P60852	638 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	DUSP6	Q16828	381 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CCDC38	Q502W7	563 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	HDHD5	Q9BXW7	423 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	DCLK3	Q9C098	648 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	MAGEH1	Q9H213	219 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CATSPERB	Q9H7T0	1116 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	TCRBV7S3A2	A0A539	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	C17orf102	A2RUQ5	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	FAM90A20P	A6NIJ5	464 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CYP1A2	P05177	515 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	TGFB3	P10600	412 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CPA1	P15085	419 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CHN1	P15882	459 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CHRNB2	P17787	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	SELENOV	P59797	346 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	KRTAP10-9	P60411	292 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	DSC1	Q08554	894 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	GPR18	Q14330	331 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	DCAF12L2	Q5VW00	463 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM217	Q8N7C4	229 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	FSIP1	Q8NA03	581 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	ENGASE	Q8NFI3	743 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	TMEM163	Q8TC26	289 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	ELP5	Q8TE02	316 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	POF1B	Q8WVV4	589 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	PHF21B	Q96EK2	531 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	IFT27	Q9BW83	186 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CADM1	Q9BY67	442 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	XRN2	Q9H0D6	950 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	KLHL31	Q9H511	634 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	MYO6	Q9UM54	1294 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402	MST1R	Q04912	1400 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MATR3-223	ENST00000514402		H0Y3Z8	333 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	SLC28A2	O43868	658 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	TMCC1	O94876	653 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	TYK2	P29597	1187 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402		Q0VFX4	171 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402		Q6ZTK2	550 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	ARHGAP30	Q7Z6I6	1101 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	CADM3	Q8N126	398 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	FAR1	Q8WVX9	515 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	OIT3	Q8WWZ8	545 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	FBXO40	Q9UH90	709 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	FZD10	Q9ULW2	581 aa		4.52	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	C4orf47	A7E2U8	309 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	MS4A18	H0YCH9	400 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	VWA5A	O00534	786 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	LCAT	P04180	440 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	CYP21A2	P08686	494 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	FCGR2A	P12318	317 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	CYP4B1	P13584	511 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	TNNT1	P13805	278 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	PNPLA4	P41247	253 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	CLCNKB	P51801	687 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	TRAF2	Q12933	501 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	THOC5	Q13769	683 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	PKP1	Q13835	747 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	NCAPH2	Q6IBW4	605 aa		4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
MATR3-223	ENST00000514402	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69

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