RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513974.5

RAI14-222, Transcript of retinoic acid induced 14, human

TSL 4

Gene RAI14, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAI14-222	ENST00000513974	HNRNPA2B1	P22626	353 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	TBXAS1	P24557	533 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	RGS7	P49802	495 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CLN3	Q13286	438 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	STIL	Q15468	1287 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF284	Q2VY69	593 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ATL3	Q6DD88	541 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	UBR7	Q8N806	425 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	OR13H1	Q8NG92	308 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CLEC4C	Q8WTT0	213 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CCDC47	Q96A33	483 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ATXN7L3B	Q96GX2	97 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CCNL2	Q96S94	520 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	TRIM62	Q9BVG3	475 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	SRRT	Q9BXP5	876 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CALN1	Q9BXU9	219 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974		F5H5T6	163 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	MOCS2	O96007	188 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	NTRK1	P04629	796 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	MYF5	P13349	255 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	PDGFRA	P16234	1089 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	PRLR	P16471	622 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	INHBC	P55103	352 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	NFATC3	Q12968	1075 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	DLG2	Q15700	870 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ACCSL	Q4AC99	568 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ZCWPW2	Q504Y3	356 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	COLEC12	Q5KU26	742 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	RAP1GAP2	Q684P5	730 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CHSY1	Q86X52	802 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CCAR2	Q8N163	923 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	EXD3	Q8N9H8	876 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	WDR36	Q8NI36	951 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	WDR48	Q8TAF3	677 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	TFAP2B	Q92481	460 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	HNRNPUL1	Q9BUJ2	856 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	GPR27	Q9NS67	375 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	STARD5	Q9NSY2	213 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ATXN7L1	Q9ULK2	861 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	NAALADL1	Q9UQQ1	740 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974		A6NNZ2	444 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974		H3BM21	787 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	PIK3R2	O00459	728 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	TPP1	O14773	563 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CSF2	P04141	144 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ITGB2	P05107	769 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	SFTPC	P11686	197 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	LINC00303	Q3SY05	128 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CBWD6	Q4V339	395 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974		Q6ZSR6	202 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	TMIE	Q8NEW7	156 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	KLK6	Q92876	244 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	ALG14	Q96F25	216 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	SEMA3C	Q99985	751 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	MAPK8IP1	Q9UQF2	711 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	FARP1	Q9Y4F1	1045 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RAI14-222	ENST00000513974	CPED1	A4D0V7	1026 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974		M0QYV0	167 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	CETN3	O15182	167 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	EFS	O43281	561 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	NEBL	O76041	1014 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	TNFSF15	O95150	251 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	KRT10	P13645	584 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	NME1	P15531	152 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	CLDN2	P57739	230 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RAI14-222	ENST00000513974	CDKN3	Q16667	212 aa		13.58	□□□□□ -0.24

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