RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512673.1

ALYREF-204, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

TSL 2

Gene ALYREF, Length 441 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-204ENST00000512673 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SPATA20Q8TB22 786 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 USP7Q93009 1102 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 BMFQ96LC9 184 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CLIC6Q96NY7 704 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 STRADBQ9C0K7 418 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 A0A087X0B3 334 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 A6NNZ2 444 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 D6RAR5 112 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 H3BM21 787 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ACSL4O60488 711 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 EXOC3O60645 756 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 GCATO75600 419 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 LATS1O95835 1130 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 JUNDP17535 347 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CCL7P80098 99 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 INCA1Q0VD86 236 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 TCEA2Q15560 299 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 RAB41Q5JT25 222 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 BSPRYQ5W0U4 402 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 HORMAD1Q86X24 394 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 DTX1Q86Y01 620 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SSC4DQ8WTU2 575 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 FRS2Q8WU20 508 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 OR8D1Q8WZ84 308 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 IFT43Q96FT9 208 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 BOCQ9BWV1 1114 aa16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ZFHX3Q15911 3703 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SDK2Q58EX2 2172 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 YJEFN3A6XGL0 299 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 E7ENQ6 273 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 H3BQV1 296 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 RAD51BO15315 384 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SPINT1O43278 529 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SEMA7AO75326 666 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PCDH8O95206 1070 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 MOCS3O95396 460 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ASS1P00966 412 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 GNLYP22749 145 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 DCTP40126 519 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 STAT6P42226 847 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CD97P48960 835 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SLC11A2P49281 568 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ACCSLQ4AC99 568 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 FHL5Q5TD97 284 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 FAM46CQ5VWP2 391 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 Q6ZVU0 165 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PARGQ86W56 976 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 WDR48Q8TAF3 677 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PARD3BQ8TEW8 1205 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 NAT6Q93015 286 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 GULP1Q9UBP9 304 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PPM1HQ9ULR3 514 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PADI4Q9UM07 663 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 F8P00451 2351 aa15.99■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 A0A1W2PQM1 296 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 C9orf172C9J069 976 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 RNF103O00237 685 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 HLA-DRAP01903 254 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF18P17022 549 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 NR1D1P20393 614 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PIK3CAP42336 1068 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 RPIAP49247 311 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ADIGQ0VDE8 80 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 DCAF6Q58WW2 860 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 PM20D1Q6GTS8 502 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 ZNF507Q8TCN5 953 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 TATDN2Q93075 761 aa15.98■□□□□ 0.15
ALYREF-204ENST00000512673 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms