RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510186.5

FAM200B-216, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-216	ENST00000510186	THADA	Q6YHU6	1953 aa		12.1	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186		A0A1B0GTW7	788 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	MEI4	A8MW99	385 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	PATE3	B3GLJ2	98 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	EIF3CL	B5ME19	914 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	CDX4	O14627	284 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	MCF2L	O15068	1137 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	RTN2	O75298	545 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	SEMA4F	O95754	770 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	PLEK	P08567	350 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	ENG	P17813	658 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	SLC8A1	P32418	973 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	ACSL1	P33121	698 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	HTR7	P34969	479 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	STK19	P49842	368 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	RPL7A	P62424	266 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	DLG2	Q15700	870 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	EFHC2	Q5JST6	749 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	VPS36	Q86VN1	386 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	DEFB119	Q8N690	84 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	CCDC114	Q96M63	670 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	MCEE	Q96PE7	176 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	EIF3C	Q99613	913 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	KDM4C	Q9H3R0	1056 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	MTG2	Q9H4K7	406 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	MRPL47	Q9HD33	250 aa	Known RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	TMPRSS4	Q9NRS4	437 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	DONSON	Q9NYP3	566 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	TAS2R14	Q9NYV8	317 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	VPS51	Q9UID3	782 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	SNX10	Q9Y5X0	201 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	SCIN	Q9Y6U3	715 aa		12.09	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		12.08	□□□□□ -0.47
FAM200B-216	ENST00000510186	RALGAPA1	Q6GYQ0	2036 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186		A0A0D9SEW6	157 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	LRRC72	A6NJI9	287 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	C4orf47	A7E2U8	309 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	DDX3X	O00571	662 aa	Known RBP eCLIP	12.08	□□□□□ -0.48	2e-14	■■■■■ 29.4
FAM200B-216	ENST00000510186	ARHGAP33	O14559	1287 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	SLC7A4	O43246	635 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	CCP110	O43303	1012 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	LRIG2	O94898	1065 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	GJB6	O95452	261 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	SERPING1	P05155	500 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	CFI	P05156	583 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	GOT1	P17174	413 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	GEMIN4	P57678	1058 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	GNA12	Q03113	381 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	CCDC15	Q0P6D6	951 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	ACCSL	Q4AC99	568 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	FAM124A	Q86V42	546 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	NLRP14	Q86W24	1093 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	CACUL1	Q86Y37	369 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	DRC7	Q8IY82	874 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	STK40	Q8N2I9	435 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	CCDC185	Q8N715	623 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	C1orf216	Q8TAB5	229 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	TBC1D31	Q96DN5	1066 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	PSMB7	Q99436	277 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	OMD	Q99983	421 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	ACE2	Q9BYF1	805 aa	Predicted RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	CEP44	Q9C0F1	390 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	ISCU	Q9H1K1	167 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	MAGEH1	Q9H213	219 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	PPM1H	Q9ULR3	514 aa		12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	LUC7L2	Q9Y383	392 aa	Known RBP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	12.08	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	TMEM191C	A6NGB0	347 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	UPK3BL1	B0FP48	263 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	C10orf142	B7Z368	130 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	UPK3BL2	E5RIL1	263 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	MID1	O15344	667 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	BCAT2	O15382	392 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	CBFA2T2	O43439	604 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	ZMPSTE24	O75844	475 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	IL1B	P01584	269 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	SRC	P12931	536 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	CD27	P26842	260 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	GALC	P54803	685 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	SLC14A1	Q13336	389 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	ACAP1	Q15027	740 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	RAB6C	Q53S08	254 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	HGSNAT	Q68CP4	663 aa		12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	RWDD4	Q6NW29	188 aa	Known RBP	12.07	□□□□□ -0.48
FAM200B-216	ENST00000510186	TMC6	Q7Z403	805 aa		12.07	□□□□□ -0.48

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.2 ms