RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 HS3ST4Q9Y661 456 aa31.03■■■□□ 2.56
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM145Q8NBT3 493 aa31.02■■■□□ 2.56
ALYREF-202ENST00000505490 PIP4K2CQ8TBX8 421 aa31.02■■■□□ 2.56
ALYREF-202ENST00000505490 CRELD1Q96HD1 420 aa31.02■■■□□ 2.56
ALYREF-202ENST00000505490 PREBQ9HCU5 417 aa31.02■■■□□ 2.56
ALYREF-202ENST00000505490 SLC25A13Q9UJS0 675 aa31.02■■■□□ 2.56
ALYREF-202ENST00000505490 BIN1O00499 593 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 CLDN11O75508 207 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 CKMT2P17540 419 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SLC9A1P19634 815 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PROX2Q3B8N5 592 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 HES3Q5TGS1 186 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SLC26A9Q7LBE3 791 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 CRACR2AQ9BSW2 395 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 APEX2Q9UBZ4 518 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 VANGL2Q9ULK5 521 aa31.01■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ACP1P24666 158 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 Q6ZVU0 165 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 C14orf80Q86SX3 495 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF683Q8IZ20 524 aa31■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PAGE1O75459 146 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 DAB1O75553 588 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 CDH4P55283 916 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 NEK5Q6P3R8 708 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PSMB7Q99436 277 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGEF38Q9NXL2 777 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SHROOM3Q8TF72 1996 aa30.99■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 DOCK4Q8N1I0 1966 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 I6L893 689 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 GRAP2O75791 330 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ERBB2P04626 1255 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 CTSLP07711 333 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SRCP12931 536 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 NOS2P35228 1153 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ABCG1P45844 678 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 APBA1Q02410 837 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 STAT4Q14765 748 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ACCSLQ4AC99 568 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ARTNQ5T4W7 220 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 RNF34Q969K3 372 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 NT5C3BQ969T7 300 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 RWDD2AQ9UIY3 292 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 VPS28Q9UK41 221 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SLC6A3Q01959 620 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ARHGAP44Q17R89 818 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PTPN20Q4JDL3 420 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 GBP6Q6ZN66 633 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 IRF2BP1Q8IU81 584 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SLC25A45Q8N413 288 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 NPY6RQ99463 290 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ANLNQ9NQW6 1124 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 COX16Q9P0S2 106 aa30.97■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 MT-CO1P00395 513 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PON1P27169 355 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PASD1Q8IV76 773 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 C1orf131Q8NDD1 294 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 TMIEQ8NEW7 156 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 OR2A12Q8NGT7 310 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PRORYQ9H606 182 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 SIX2Q9NPC8 291 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 RRN3Q9NYV6 651 aa30.96■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 TRIM38O00635 465 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 CNTN5O94779 1100 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 GGCXP38435 758 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 CXCR3P49682 368 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 NME3Q13232 169 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 EXOC3L4Q17RC7 722 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ALFQ53S48 1182 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 BRMS1LQ5PSV4 323 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 OR6B2Q6IFH4 312 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 KLHDC7BQ96G42 594 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 NOX5Q96PH1 765 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 PIGVQ9NUD9 493 aa30.95■■■□□ 2.55
ALYREF-202ENST00000505490 DRGXA6NNA5 263 aa30.94■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms