RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504450.1

SH3BP2-209, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 844 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC43Q8N309 656 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 OTUD6BQ8N6M0 293 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKS4BQ8N8V4 417 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO32Q969P5 355 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 AGAP3Q96P47 875 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF576Q9H609 170 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GLOD4Q9HC38 313 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PRDM6Q9NQX0 595 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 NDFIP2Q9NV92 336 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF212Q9UDV6 495 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TBX21Q9UL17 535 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 STARD13Q9Y3M8 1113 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TET1Q8NFU7 2136 aa11.02□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZCWPW2A0A1B0GU75 182 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEB16A2A368 324 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ARHGAP42A6NI28 874 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 DFFAO00273 331 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 LPXNO60711 386 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 EDF1O60869 148 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 KIAA0754O94854 1291 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 FSBPO95073 299 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TBX18O95935 607 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CCNB1P14635 433 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CPB1P15086 417 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ATF6P18850 670 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PBX3P40426 434 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 NDST2P52849 883 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 RING1Q06587 406 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TNK2Q07912 1038 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 EFEMP1Q12805 493 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 DUSP4Q13115 394 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 OLIG2Q13516 323 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PRPSAP1Q14558 356 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SPRED3Q2MJR0 410 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MGAT5BQ3V5L5 792 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 C5orf22Q49AR2 442 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SNX30Q5VWJ9 437 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PACS1Q6VY07 963 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC121Q6ZUS5 278 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 OTOP3Q7RTS5 596 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CNPY4Q8N129 248 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM199Q8N511 208 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ATPAF2Q8N5M1 289 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXO22Q8NEZ5 403 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GPR152Q8TDT2 470 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SPOCK2Q92563 424 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PITPNM3Q9BZ71 974 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC40Q9H9A6 602 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 BFARQ9NZS9 450 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MPP6Q9NZW5 540 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MARCH2Q9P0N8 246 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ARL2BPQ9Y2Y0 163 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PLLPQ9Y342 182 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 COL4A6Q14031 1691 aa11.01□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM265A0A087WTH1 108 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 AP3B1O00203 1094 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 USP12O75317 370 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 USP1O94782 785 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 IL1BP01584 269 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 POLBP06746 335 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 IGFBP4P22692 258 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ADRA1AP35348 466 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 MAGEA9P43362 315 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 BMPR2Q13873 1038 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 USP41Q3LFD5 358 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 GALNTL6Q49A17 601 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TMEM240Q5SV17 173 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CERCAMQ5T4B2 595 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 RNF43Q68DV7 783 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 DENND5AQ6IQ26 1287 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 FBXL22Q6P050 247 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CNKSR3Q6P9H4 555 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 DEFB128Q7Z7B8 93 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 LRRC8CQ8TDW0 803 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 ACMSDQ8TDX5 336 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 USP33Q8TEY7 942 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 IGSF21Q96ID5 467 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 BTN2A3PQ96KV6 586 aa11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
SH3BP2-209ENST00000504450 PLCD4Q9BRC7 762 aa11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms