RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC25Q86WR0 208 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 STAMQ92783 540 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 RNFT2Q96EX2 444 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SPAG4Q9NPE6 437 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 UPB1Q9UBR1 384 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 GDAQ9Y2T3 454 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 A0A1W2PPC1 479 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 RRN3P2A6NIE6 340 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 C17orf100A8MU93 164 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF814B7Z6K7 855 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 PEX12O00623 359 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 NCAM2O15394 837 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 MOSPD3O75425 235 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 POLBP06746 335 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 FCGR2AP12318 317 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 CNTFP26441 200 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 CCR5P51681 352 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 CHRNDQ07001 517 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ALG10Q5BKT4 473 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ALG10BQ5I7T1 473 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SH2D4BQ5SQS7 431 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 C6orf10Q5SRN2 563 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 TTLL5Q6EMB2 1281 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF425Q6IV72 752 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 C1QL2Q7Z5L3 287 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 IGFN1Q86VF2 1251 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 NCSTNQ92542 709 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 MAELQ96JY0 434 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ELOVL5Q9NYP7 299 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SUFUQ9UMX1 484 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 COG5Q9UP83 839 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 STRNO43815 780 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SH3BP5O60239 455 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 PYGLP06737 847 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 WEE2P0C1S8 567 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SLC16A2P36021 539 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 MTNR1AP48039 350 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ME1P48163 572 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 PLCD1P51178 756 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 TLE2Q04725 743 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 GAD2Q05329 585 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 POU5F1BQ06416 359 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 IL13RA2Q14627 380 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 WDR45BQ5MNZ6 344 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ENTPD8Q5MY95 495 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ATG16L1Q676U5 607 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 AAGABQ6PD74 315 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 KDELC2Q7Z4H8 507 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SLC25A41Q8N5S1 370 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SCAIQ8N9R8 606 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 HIPK3Q9H422 1215 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM160Q9NX00 188 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 GGA3Q9NZ52 723 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 RNF7Q9UBF6 113 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 OSGIN2Q9Y236 505 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 A6NNC1 897 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SOCS2O14508 198 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ATG13O75143 517 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 AGR2O95994 175 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM191BP0C7N4 346 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 HNF1BP35680 557 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 GJC1P36383 396 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 MANEAQ5SRI9 462 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ASPHD1Q5U4P2 390 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 TMEM268Q5VZI3 342 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 CCDC70Q6NSX1 233 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 MMP21Q8N119 569 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 NRACQ8N912 160 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 FRG2BQ96QU4 278 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 IFT27Q9BW83 186 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
PTPRK-215ENST00000498284 DECR2Q9NUI1 292 aa4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.4 ms