RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494800.1

HDAC4-211, Transcript of histone deacetylase 4, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC4, Length 451 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4-211ENST00000494800 SLC8A1P32418 973 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 PSMD8P48556 350 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 MAPKAPK2P49137 400 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 CLCN6P51797 869 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 IRX4P78413 519 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 DLG2Q15700 870 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 RAB6CQ53S08 254 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 DCAF12L1Q5VU92 463 aa18.08■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 DRC7Q8IY82 874 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 STK40Q8N2I9 435 aa18.08■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 SH2D3CQ8N5H7 860 aa18.08■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa18.07■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 CBX4O00257 560 aa18.07■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 ALOX15BO15296 676 aa18.07■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 TRIM14Q14142 442 aa18.07■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 DNASE2BQ8WZ79 361 aa18.07■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 SNX19Q92543 992 aa18.07■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 NCAPGQ9BPX3 1015 aa18.07■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa18.07■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa18.07■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 HPCAL4Q9UM19 191 aa18.07■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 ABCA7Q8IZY2 2146 aa18.07■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 A0A1B0GTW7 788 aa18.06■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 A0A1W2PP55 124 aa18.06■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 LRRC72A6NJI9 287 aa18.06■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 SRCP12931 536 aa18.06■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 CATSPERBQ9H7T0 1116 aa18.06■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 TMEM248Q9NWD8 314 aa18.06■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 DCDC2BA2VCK2 349 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 C4orf47A7E2U8 309 aa18.05■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 RAMP2O60895 175 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 GYPCP04921 128 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 VAV1P15498 845 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 GOT1P17174 413 aa18.05■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 CASP14P31944 242 aa18.05■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 MAPK8P45983 427 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 CCDC15Q0P6D6 951 aa18.05■□□□□ 0.48
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HDAC4-211ENST00000494800 C6orf106Q9H6K1 298 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 MYO1AQ9UBC5 1043 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 ZNF212Q9UDV6 495 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 DNAI1Q9UI46 699 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 FZD10Q9ULW2 581 aa18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 SDK1Q7Z5N4 2213 aa18.04■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 FAM47DPA6NHR8 397 aa18.04■□□□□ 0.48
HDAC4-211ENST00000494800 FAM72CH0Y354 149 aa18.04■□□□□ 0.48
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