RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP17.06■□□□□ 0.32
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TOM1-216ENST00000492723 CDY1Q9Y6F8 540 aa17.06■□□□□ 0.32
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TOM1-216ENST00000492723 ECT2Q9H8V3 914 aa17.04■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 C20orf96Q9NUD7 363 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 SOX13Q9UN79 622 aa17.04■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 F7P08709 466 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
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TOM1-216ENST00000492723 IRX4P78413 519 aa17.04■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
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TOM1-216ENST00000492723 ADAM12O43184 909 aa17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 CXCL10P02778 98 aa17.03■□□□□ 0.32
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TOM1-216ENST00000492723 ANO4Q32M45 955 aa17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 KCNMB4Q86W47 210 aa17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 NUDCD3Q8IVD9 361 aa17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 RFWD2Q8NHY2 731 aa17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 HMCESQ96FZ2 354 aa17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 MYLK2Q9H1R3 596 aa17.03■□□□□ 0.32
TOM1-216ENST00000492723 FNIP2Q9P278 1114 aa17.03■□□□□ 0.32
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